27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3882 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  90.86 
 
 		 340 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  55.63 
 
 		 330 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  53.7 
 
 		 339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  50.32 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  40.69 
 
 		 358 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  39.37 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  38.99 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  42.86 
 
 		 359 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  40.14 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  39.61 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  40.91 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  35.67 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  39.29 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  31.62 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  31.62 
 
 		 283 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  30.11 
 
 		 322 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  28.82 
 
 		 353 aa  92.4  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  29.69 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  28.67 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  30.2 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  28.09 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  28.2 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  24.72 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  25.15 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  25.15 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>