21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2751 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  647    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  38.2 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  30.38 
 
 		 359 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  31.4 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  32.35 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  31.08 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  31.4 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  30.27 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  30.03 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  31.39 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  29.12 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  28.01 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  27.46 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  27.45 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  29.35 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  27.3 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  26.95 
 
 		 322 aa  49.7  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  30.56 
 
 		 296 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  23.67 
 
 		 339 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  28.68 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  30.04 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>