35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2660 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  55.35 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  52.99 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  52.99 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  48.36 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  41.79 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  29.93 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  31.46 
 
 		 382 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  32.98 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  29.41 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  30.63 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  29.74 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  29.83 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  31 
 
 		 332 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  30.74 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  32.6 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  30.11 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  29.37 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  27.79 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  30.94 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  28.04 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  28.41 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  25.77 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  28.16 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  23.28 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  24.17 
 
 		 387 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  24.08 
 
 		 383 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  26.35 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.82 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2552  lipoprotein  27.41 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  25.13 
 
 		 384 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  24.39 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  23.9 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  24.67 
 
 		 461 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  24.54 
 
 		 793 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>