35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2288 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  632  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  34.81 
 
 		 359 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  31.88 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  30.4 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  31.29 
 
 		 382 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  33.88 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  33.12 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  32.98 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  32.7 
 
 		 385 aa  99.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  29.71 
 
 		 341 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  31.58 
 
 		 352 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  30.77 
 
 		 356 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  32.11 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  26.81 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  29.97 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  30.2 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  27.14 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  29.31 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  27.68 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  27.84 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  27.99 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  30.48 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 		 1016 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  26.69 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  23.95 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  24.15 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  24.49 
 
 		 396 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  26.79 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  23.1 
 
 		 379 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  22.99 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  33.04 
 
 		 390 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.01 
 
 		 657 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  27.22 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  27.32 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>