50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4386 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  778    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  53.48 
 
 
383 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.23 
 
 
383 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  50.27 
 
 
387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  46.26 
 
 
419 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  40.51 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.3 
 
 
1016 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  39.9 
 
 
396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  43.24 
 
 
1844 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  40.2 
 
 
410 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  40.2 
 
 
410 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  34.6 
 
 
384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  35.54 
 
 
354 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  34 
 
 
399 aa  176  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  34.06 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  32.87 
 
 
376 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  31.58 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  33.9 
 
 
381 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  33.43 
 
 
389 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  31.94 
 
 
345 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  32.4 
 
 
401 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  30.23 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  29.83 
 
 
388 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  29.66 
 
 
404 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  29.22 
 
 
363 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  26.37 
 
 
501 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  27.2 
 
 
501 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  31.59 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.75 
 
 
494 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.45 
 
 
657 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  30.27 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  31.64 
 
 
348 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  29.28 
 
 
494 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  25.96 
 
 
515 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  27.92 
 
 
504 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  22.69 
 
 
429 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  24.51 
 
 
466 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  27.35 
 
 
491 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  30.3 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  26.3 
 
 
699 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  25.81 
 
 
512 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  33.04 
 
 
318 aa  46.6  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  25.19 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  25.15 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  25.61 
 
 
723 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  23.81 
 
 
438 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  27.2 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  23.68 
 
 
456 aa  43.1  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  24.74 
 
 
461 aa  43.1  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  34.17 
 
 
486 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>