25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2558 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  100 
 
 		 330 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  54.43 
 
 		 340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  53.21 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  48.48 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  48.77 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  39.01 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  37.06 
 
 		 359 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  38.83 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  34.64 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  37.74 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  35.28 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  37.5 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  35.58 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  37.33 
 
 		 385 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  33.57 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  33.92 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  33.11 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  33.1 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  31.25 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  32.6 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  28.34 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  28.33 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  27.08 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  26.28 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  24.23 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>