31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0496 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  764    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  70.57 
 
 		 384 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  78.05 
 
 		 359 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  71.25 
 
 		 332 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  61.3 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  62.75 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  59.43 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  44.05 
 
 		 341 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  39.61 
 
 		 345 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  37.43 
 
 		 340 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  37.62 
 
 		 339 aa  199  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  38.89 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  38.82 
 
 		 330 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  38.8 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  31.9 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  31.46 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  31.51 
 
 		 352 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  31.72 
 
 		 283 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  31.46 
 
 		 297 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  31.34 
 
 		 296 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  29.39 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  29.41 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  27.41 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  29.35 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  28.27 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 		 1016 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  25.23 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  26.79 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  34.02 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  26.79 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  26.13 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>