54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0187 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  794    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  53.8 
 
 
394 aa  353  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.54 
 
 
1016 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  49.3 
 
 
419 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  50 
 
 
410 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  50 
 
 
410 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  47.06 
 
 
1844 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  38.25 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  39.19 
 
 
354 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  42.29 
 
 
390 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  37.65 
 
 
379 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  42.35 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.09 
 
 
383 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  34.46 
 
 
399 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  40.29 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  33.52 
 
 
381 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  35.07 
 
 
376 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  31.52 
 
 
389 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  33.05 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  32.76 
 
 
404 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  33.07 
 
 
384 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  33.05 
 
 
345 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  31.14 
 
 
388 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  29.97 
 
 
401 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  32.69 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  31.38 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.35 
 
 
657 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  23.45 
 
 
494 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  24.24 
 
 
501 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  23.22 
 
 
501 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  26.39 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.29 
 
 
494 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  26.67 
 
 
504 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.72 
 
 
466 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  25.44 
 
 
340 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  25.48 
 
 
512 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  25.15 
 
 
345 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  24.49 
 
 
318 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  27.47 
 
 
438 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  23.84 
 
 
358 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  24.73 
 
 
429 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  25.89 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  25 
 
 
515 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  22.22 
 
 
330 aa  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  24.71 
 
 
490 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  25.07 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  26.73 
 
 
854 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  25.41 
 
 
491 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  23.81 
 
 
454 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  23.53 
 
 
486 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  25.45 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  26.25 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.106647 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 
489 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  25.62 
 
 
495 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>