66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2270 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  978    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  63.75 
 
 
490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  51.48 
 
 
854 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  36.42 
 
 
491 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  36.9 
 
 
495 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  35.64 
 
 
495 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  35.96 
 
 
515 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  26.04 
 
 
501 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.86 
 
 
501 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  25.93 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  26.42 
 
 
494 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  33.16 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  28.96 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  30 
 
 
494 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  25.97 
 
 
504 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  27.86 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26.11 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  28.78 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  26.22 
 
 
513 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  25.84 
 
 
513 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  25.35 
 
 
469 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  25.23 
 
 
513 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  25.28 
 
 
513 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  25.8 
 
 
458 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  25.48 
 
 
458 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  20.74 
 
 
441 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  20.74 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  25.93 
 
 
945 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  28.63 
 
 
452 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  25.92 
 
 
454 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  23.88 
 
 
448 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  23.88 
 
 
448 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  24.24 
 
 
448 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  26.7 
 
 
1844 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  23.76 
 
 
451 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  31.25 
 
 
415 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  26.32 
 
 
452 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  23.99 
 
 
452 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  24.41 
 
 
461 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  24.16 
 
 
454 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  24.17 
 
 
448 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  24.85 
 
 
384 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  25.25 
 
 
457 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.56 
 
 
769 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  28.04 
 
 
438 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  26.98 
 
 
453 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  26.28 
 
 
448 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  25.93 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  25.53 
 
 
457 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  25.69 
 
 
451 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  24.75 
 
 
457 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  29.41 
 
 
454 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  25.93 
 
 
410 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  24.89 
 
 
452 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  23.03 
 
 
456 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  24.74 
 
 
376 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  25.86 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  25.4 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  26.12 
 
 
487 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  27.89 
 
 
390 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  29.87 
 
 
399 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  27.31 
 
 
473 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  25.64 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  27.68 
 
 
417 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  23.53 
 
 
396 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>