65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3529 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  994    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  68.74 
 
 		 491 aa  686    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  92.32 
 
 		 495 aa  900    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  48.01 
 
 		 515 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  42.47 
 
 		 854 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  35.62 
 
 		 489 aa  299  8e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  37.87 
 
 		 490 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  36.74 
 
 		 486 aa  239  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  28.5 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.4 
 
 		 429 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.93 
 
 		 501 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.73 
 
 		 501 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  27.81 
 
 		 438 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  31.38 
 
 		 469 aa  90.5  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.72 
 
 		 494 aa  87  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  28.42 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  26.4 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  26.62 
 
 		 504 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  29.85 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  28.48 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  29.17 
 
 		 513 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  28.39 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  28.85 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  27.42 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  28.06 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  27.89 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  28.64 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26.55 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  28.21 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  25.33 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  27.21 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  28.11 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  24.92 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  27.18 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  26.12 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  24.87 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  25.38 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.09 
 
 		 769 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  25.5 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  26.32 
 
 		 461 aa  53.9  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  27.32 
 
 		 417 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  28.09 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  26.57 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  24.93 
 
 		 945 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  24.66 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  27.73 
 
 		 381 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  23.93 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  24.04 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  23.31 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  25.35 
 
 		 1844 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  27.05 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  23.18 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  24.26 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  23.18 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  26.97 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  22.18 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  23.83 
 
 		 998 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  27.18 
 
 		 384 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  23.83 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0173  hypothetical protein  23.87 
 
 		 306 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854745  hitchhiker  0.0000000557216 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  25.62 
 
 		 396 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.78 
 
 		 1027 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  27.86 
 
 		 410 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  30.3 
 
 		 451 aa  43.5  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  25.87 
 
 		 2852 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>