57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2173 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  69.89 
 
 		 495 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  993    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  70.68 
 
 		 495 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  46.79 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  41.89 
 
 		 854 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 		 489 aa  291  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  36.55 
 
 		 486 aa  243  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  35.37 
 
 		 490 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  26.91 
 
 		 504 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  26.85 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  29.05 
 
 		 466 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.54 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  28.67 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  28.97 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  26.34 
 
 		 501 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.96 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  26.85 
 
 		 501 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  29.55 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  25.48 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  28.71 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  28.71 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  28.22 
 
 		 513 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  28.22 
 
 		 513 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  25.95 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  29.59 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  26.67 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  28.27 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  26.25 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  24.8 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  32.12 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  25.23 
 
 		 699 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  24.92 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  26.4 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  26.4 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  26.69 
 
 		 451 aa  57  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  26.07 
 
 		 417 aa  57  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  28.42 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.66 
 
 		 1027 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  26.32 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  27.98 
 
 		 1844 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  25.73 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  28.17 
 
 		 410 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  25.55 
 
 		 1175 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  27.35 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  29.2 
 
 		 376 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  28.17 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.85 
 
 		 769 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  25.41 
 
 		 396 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.45 
 
 		 1372 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  25.91 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  23.34 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  24.07 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  27.12 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  22.72 
 
 		 458 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  25.69 
 
 		 487 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  24.26 
 
 		 401 aa  43.5  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>