72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1112 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  909    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  99.56 
 
 
457 aa  907    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  43.9 
 
 
390 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  42.56 
 
 
417 aa  278  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  42.13 
 
 
415 aa  269  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  40.14 
 
 
487 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.94 
 
 
769 aa  239  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  35.96 
 
 
452 aa  236  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  36.11 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  36.2 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  35.75 
 
 
458 aa  230  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  36.42 
 
 
448 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  36.42 
 
 
448 aa  229  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  36.06 
 
 
454 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  34.3 
 
 
448 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  35.91 
 
 
452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  36.2 
 
 
448 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  36.26 
 
 
464 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  35.79 
 
 
454 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  35.02 
 
 
473 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  34.38 
 
 
451 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  35.32 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  34.4 
 
 
452 aa  217  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  34.36 
 
 
451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  33.76 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  34.83 
 
 
441 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  35.07 
 
 
441 aa  213  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  34.94 
 
 
448 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 
1027 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  33.7 
 
 
451 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  32.47 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  33.99 
 
 
451 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.96 
 
 
1372 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.58 
 
 
501 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  29.58 
 
 
501 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  35.16 
 
 
512 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  32.22 
 
 
438 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  30.74 
 
 
504 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  29.67 
 
 
429 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  33.33 
 
 
472 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  30.5 
 
 
456 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  31.19 
 
 
494 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  28.04 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  28.04 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  28.04 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  27.68 
 
 
513 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.92 
 
 
469 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  26.71 
 
 
494 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  30.22 
 
 
515 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  26.89 
 
 
1844 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  27.27 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  28.44 
 
 
208 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  25.36 
 
 
453 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  27.14 
 
 
470 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  26.4 
 
 
491 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  24.87 
 
 
495 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  26.48 
 
 
453 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  24.29 
 
 
495 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  27.13 
 
 
461 aa  53.9  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  26.44 
 
 
451 aa  53.9  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  26.56 
 
 
451 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25.25 
 
 
486 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49693  predicted protein  24.07 
 
 
525 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  25.24 
 
 
854 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  25.76 
 
 
348 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  28.8 
 
 
760 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  24.81 
 
 
457 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  21.38 
 
 
454 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  35.29 
 
 
510 aa  47  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  27.66 
 
 
438 aa  47  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  25.91 
 
 
793 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  23.13 
 
 
998 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>