57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0107 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  87.89 
 
 		 448 aa  821    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  87.89 
 
 		 448 aa  822    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  77.7 
 
 		 458 aa  680    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  921    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  77.22 
 
 		 458 aa  679    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  87.89 
 
 		 448 aa  822    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  68.25 
 
 		 451 aa  624  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  69.12 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  64.43 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  63.41 
 
 		 451 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  62.93 
 
 		 451 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  62.53 
 
 		 448 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  62.05 
 
 		 451 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  63.98 
 
 		 451 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  62.41 
 
 		 452 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  55.05 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  50.34 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  50.34 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  53.95 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  52.22 
 
 		 452 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  52.68 
 
 		 452 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  54.52 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  52.91 
 
 		 452 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  46.1 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  39.84 
 
 		 417 aa  240  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  38.52 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  34.3 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  34.3 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  39.95 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.2 
 
 		 769 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  48.04 
 
 		 208 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  30.66 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.1 
 
 		 1027 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.8 
 
 		 1372 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.86 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  28.72 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  30.23 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.8 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.39 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  23.19 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  24.55 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49693  predicted protein  26.6 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  25.78 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  24.17 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26.19 
 
 		 470 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  22.97 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  31.29 
 
 		 494 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  29.8 
 
 		 1844 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  22.55 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  24.37 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  29.23 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  24.56 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  31.25 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  22.6 
 
 		 495 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  28.66 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  23.4 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>