63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0828 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  885    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  99.55 
 
 
441 aa  879    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  51 
 
 
451 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  50.45 
 
 
448 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  50.45 
 
 
448 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  50.34 
 
 
448 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  50.45 
 
 
448 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  48.32 
 
 
454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  51.12 
 
 
451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  52.27 
 
 
458 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  51.17 
 
 
452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  51.79 
 
 
458 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  50 
 
 
451 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  49.33 
 
 
451 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  50.12 
 
 
451 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  49.41 
 
 
452 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  46.19 
 
 
448 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  46.58 
 
 
452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  46.58 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  46.22 
 
 
454 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  44.16 
 
 
452 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  47.7 
 
 
473 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  43.91 
 
 
464 aa  348  8e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  37.73 
 
 
451 aa  316  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  37.05 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  32.63 
 
 
417 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  35.07 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  34.83 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  34.42 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.72 
 
 
769 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  43.68 
 
 
208 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  31.13 
 
 
487 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.93 
 
 
1027 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.1 
 
 
1372 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  25.07 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  23.13 
 
 
501 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  23.13 
 
 
501 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  22.04 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.48 
 
 
494 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  32.52 
 
 
1844 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  21.27 
 
 
486 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  22.97 
 
 
461 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  24.41 
 
 
451 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  22.37 
 
 
490 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  27.34 
 
 
470 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  23.19 
 
 
512 aa  56.6  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  24.33 
 
 
504 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  22.1 
 
 
454 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  24.53 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  23.36 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  22.28 
 
 
345 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  26.89 
 
 
494 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 
489 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.9 
 
 
466 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  22.58 
 
 
472 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  23.29 
 
 
376 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  21.88 
 
 
453 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  22.26 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  25.09 
 
 
469 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  24.06 
 
 
854 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  22.3 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  26.42 
 
 
515 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  25.1 
 
 
1175 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>