66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1247 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  91.15 
 
 		 452 aa  851    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  914    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  66.74 
 
 		 454 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  66.36 
 
 		 452 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  56.17 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  55.73 
 
 		 451 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  54.85 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  56.15 
 
 		 451 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  55.68 
 
 		 452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  55.92 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  52.43 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  53.33 
 
 		 448 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  52.37 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  50.78 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  52.68 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  51.72 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  50.78 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  52.4 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  50.56 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  51.66 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  51.3 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  46.58 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  46.58 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  44.72 
 
 		 451 aa  363  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  35.96 
 
 		 457 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  35.74 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  37.41 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  35.27 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  38.34 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.92 
 
 		 769 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  47.7 
 
 		 208 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  31.58 
 
 		 487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.13 
 
 		 1027 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.27 
 
 		 1372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.5 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  28.28 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  26.81 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  23.83 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  23.49 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  27.32 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  33.73 
 
 		 1844 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  29.22 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  27.46 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49693  predicted protein  25 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  25.64 
 
 		 513 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  25.26 
 
 		 470 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  31.82 
 
 		 490 aa  53.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  30.59 
 
 		 451 aa  53.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  25.64 
 
 		 513 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  25.64 
 
 		 513 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.57 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  25.64 
 
 		 513 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  28.86 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  32.35 
 
 		 456 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25 
 
 		 486 aa  50.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  25.47 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  29.61 
 
 		 854 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  28.31 
 
 		 1175 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  26.26 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  28.14 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  26.97 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  28.85 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  26.97 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  22.73 
 
 		 998 aa  43.1  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  26.55 
 
 		 491 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>