87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4033 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1016    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  43.9 
 
 		 429 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  42.12 
 
 		 438 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  39.58 
 
 		 513 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  39.31 
 
 		 513 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  39.05 
 
 		 513 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  39.05 
 
 		 513 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  32.7 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  32.69 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  32.85 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  32.27 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  30.1 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  32.41 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  32.06 
 
 		 457 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  33.43 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  32.85 
 
 		 454 aa  134  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  31.83 
 
 		 1844 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  29.52 
 
 		 998 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  27.66 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  27.81 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  31 
 
 		 699 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  32.6 
 
 		 504 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  29.04 
 
 		 1175 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  33.89 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.87 
 
 		 501 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  32.71 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  29.33 
 
 		 526 aa  99.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  28.5 
 
 		 494 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  29.33 
 
 		 501 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  32.2 
 
 		 466 aa  91.3  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.46 
 
 		 3977 aa  90.9  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  30.68 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  30.04 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  26.4 
 
 		 945 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  33.06 
 
 		 854 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  28.51 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  29.85 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  27.44 
 
 		 2852 aa  73.6  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  28.74 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  30.99 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  25.58 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  27.86 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  27.41 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  26.43 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  28.72 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  27.04 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  26.13 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  26.83 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.41 
 
 		 769 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  27.05 
 
 		 733 aa  60.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.74 
 
 		 1016 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  31.07 
 
 		 760 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  23.19 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  23.19 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  25.78 
 
 		 448 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  28.07 
 
 		 345 aa  54.3  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  29.25 
 
 		 448 aa  53.9  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  29.25 
 
 		 448 aa  53.9  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  29.25 
 
 		 448 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  26.52 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  26.88 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  25.99 
 
 		 399 aa  50.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  27.22 
 
 		 454 aa  50.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  23.31 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  25.47 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  25.69 
 
 		 729 aa  49.7  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  23.93 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  23.21 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  26.75 
 
 		 354 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.43 
 
 		 1027 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  27.27 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  25.3 
 
 		 729 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  24.65 
 
 		 376 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  26.49 
 
 		 396 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  23.61 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  23.72 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  26.84 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  24.86 
 
 		 451 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  37.04 
 
 		 348 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  23.6 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  23.48 
 
 		 451 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  27.08 
 
 		 381 aa  43.9  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  25.91 
 
 		 401 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  23.34 
 
 		 384 aa  43.5  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.57 
 
 		 1372 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  23.14 
 
 		 451 aa  43.5  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>