57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1793 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  100 
 
 
448 aa  904    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  70.82 
 
 
452 aa  631  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  68.33 
 
 
451 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  65.69 
 
 
451 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  66.97 
 
 
451 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  67.76 
 
 
451 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  67.87 
 
 
454 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  64.08 
 
 
451 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  66.82 
 
 
452 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  62.53 
 
 
448 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  61.54 
 
 
448 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  61.54 
 
 
448 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  61.31 
 
 
448 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  62.11 
 
 
458 aa  541  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  61.87 
 
 
458 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  59.35 
 
 
464 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  59.37 
 
 
473 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  56.04 
 
 
452 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  54.51 
 
 
454 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  53.79 
 
 
452 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  53.33 
 
 
452 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  50.66 
 
 
451 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  46.19 
 
 
441 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  46.19 
 
 
441 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  40.64 
 
 
415 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  39.25 
 
 
390 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  34.94 
 
 
457 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  34.52 
 
 
457 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  37.27 
 
 
417 aa  206  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.12 
 
 
769 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  48.89 
 
 
208 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  28.54 
 
 
487 aa  123  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.81 
 
 
1027 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.87 
 
 
1372 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  26.92 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  25.54 
 
 
504 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  22.65 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.06 
 
 
501 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  26.79 
 
 
494 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  24.81 
 
 
501 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.22 
 
 
469 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  28.93 
 
 
1844 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  25.9 
 
 
470 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  28.05 
 
 
494 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49693  predicted protein  23.9 
 
 
525 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  33.06 
 
 
490 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  26.28 
 
 
486 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  22.49 
 
 
489 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  22.56 
 
 
472 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  21.18 
 
 
454 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  23.93 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  27.97 
 
 
515 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  29.22 
 
 
451 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  26.35 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  28.17 
 
 
466 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  26.32 
 
 
438 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 
854 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>