82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0228 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  771    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  53.85 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.48 
 
 		 769 aa  290  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  43.9 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  43.66 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  44.42 
 
 		 417 aa  279  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  39.81 
 
 		 451 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  38.77 
 
 		 454 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  39.78 
 
 		 473 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  41.44 
 
 		 464 aa  235  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  40.84 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  38.41 
 
 		 454 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  38.8 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  38.35 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  38.35 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  38.39 
 
 		 452 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  37.05 
 
 		 448 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  37.62 
 
 		 458 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  37.41 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  37.38 
 
 		 458 aa  226  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  37.3 
 
 		 448 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  37.05 
 
 		 441 aa  222  7e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  36.41 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  36.06 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  37.05 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  35.56 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  39.48 
 
 		 451 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  35.96 
 
 		 451 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  37.53 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  36.52 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  34.12 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.97 
 
 		 1027 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.45 
 
 		 1372 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  39.08 
 
 		 208 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  29.71 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  26.32 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  27.92 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  26.45 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  27.21 
 
 		 501 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  25.25 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  27.87 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  28.32 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  25.36 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.81 
 
 		 1844 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  27.41 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  28.15 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  25.64 
 
 		 854 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  28.84 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  29.63 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  27.13 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  22.89 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  22.03 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  27.09 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  22.89 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  22.89 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  27.18 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  23.48 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49693  predicted protein  23.53 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  27.89 
 
 		 495 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  28.42 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  26.34 
 
 		 469 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  24.89 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  28.4 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  29.59 
 
 		 466 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  23.21 
 
 		 998 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  31.15 
 
 		 776 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  28.69 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  26.54 
 
 		 732 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  29.32 
 
 		 775 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  25 
 
 		 732 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  30.4 
 
 		 345 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  27.89 
 
 		 486 aa  46.6  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  24.69 
 
 		 720 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  25.93 
 
 		 731 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  28.89 
 
 		 1175 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  26.3 
 
 		 490 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  29.94 
 
 		 494 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  31.21 
 
 		 504 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  22.88 
 
 		 510 aa  43.1  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  24.58 
 
 		 719 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  23.6 
 
 		 699 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>