72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5115 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  57.67 
 
 		 729 aa  798    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  100 
 
 		 720 aa  1442    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  46.29 
 
 		 754 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  67.53 
 
 		 723 aa  939    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  67.91 
 
 		 721 aa  957    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  55.52 
 
 		 733 aa  793    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  56.6 
 
 		 732 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  58.78 
 
 		 723 aa  835    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  59.43 
 
 		 731 aa  813    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  46.79 
 
 		 760 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  57.7 
 
 		 719 aa  814    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  67.67 
 
 		 723 aa  941    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  57.16 
 
 		 732 aa  804    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  46.15 
 
 		 754 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  57.95 
 
 		 729 aa  805    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  42.41 
 
 		 793 aa  480  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  41.44 
 
 		 775 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  41.27 
 
 		 776 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  38.29 
 
 		 423 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.32 
 
 		 1641 aa  91.3  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.94 
 
 		 1641 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  41.54 
 
 		 498 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  39.32 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  40.74 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  23.99 
 
 		 624 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  25.07 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  24.83 
 
 		 624 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  24.78 
 
 		 624 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  24.89 
 
 		 624 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  24.61 
 
 		 624 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  24.61 
 
 		 624 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.36 
 
 		 3977 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  23.09 
 
 		 624 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  24.01 
 
 		 627 aa  64.7  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  21.04 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.61 
 
 		 2701 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  37.76 
 
 		 551 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  31.37 
 
 		 633 aa  60.8  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  31.45 
 
 		 539 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  31.45 
 
 		 539 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  34.33 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  33.71 
 
 		 600 aa  58.9  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  26.39 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  31.82 
 
 		 622 aa  58.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  38.95 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  37.11 
 
 		 599 aa  57  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 629 aa  57.4  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  35.96 
 
 		 1322 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  26.67 
 
 		 2796 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  32.37 
 
 		 1355 aa  55.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  31.5 
 
 		 1587 aa  55.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  39.47 
 
 		 2852 aa  54.7  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.21 
 
 		 774 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  29.57 
 
 		 589 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  22.34 
 
 		 857 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  30.52 
 
 		 592 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  32.56 
 
 		 624 aa  52  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  24.23 
 
 		 589 aa  51.6  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  32.56 
 
 		 635 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  24.17 
 
 		 1175 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  33.64 
 
 		 2182 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  25 
 
 		 429 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  26.82 
 
 		 598 aa  50.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  24.23 
 
 		 600 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  33.72 
 
 		 621 aa  49.3  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  23.08 
 
 		 601 aa  48.5  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  24.69 
 
 		 453 aa  48.9  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  25.73 
 
 		 451 aa  48.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  34.74 
 
 		 567 aa  48.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  24.69 
 
 		 390 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  24.27 
 
 		 453 aa  45.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  30.34 
 
 		 622 aa  44.3  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>