71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2092 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 854 aa  1659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  54.49 
 
 		 490 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  51.48 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  42.83 
 
 		 495 aa  330  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  41.89 
 
 		 491 aa  328  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  42.46 
 
 		 495 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  40 
 
 		 515 aa  298  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  31.64 
 
 		 489 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.93 
 
 		 501 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  29.93 
 
 		 501 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  30.95 
 
 		 494 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  28.9 
 
 		 429 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  29.86 
 
 		 494 aa  99  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  29.07 
 
 		 469 aa  97.8  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  30.34 
 
 		 438 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  31.07 
 
 		 466 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  26.88 
 
 		 504 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  31.05 
 
 		 513 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  31.05 
 
 		 513 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  31.05 
 
 		 513 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  31.05 
 
 		 513 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  34.72 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  30.24 
 
 		 472 aa  80.5  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  29.06 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  26.54 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  29.31 
 
 		 1844 aa  71.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  26.43 
 
 		 1175 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  27.24 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  25.64 
 
 		 390 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  25 
 
 		 998 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  27.59 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26.58 
 
 		 470 aa  62  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  23.53 
 
 		 454 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  25.62 
 
 		 438 aa  60.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  25.82 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  25.96 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 		 1016 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  25.18 
 
 		 457 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  29.19 
 
 		 415 aa  55.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  23.57 
 
 		 487 aa  53.9  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  25.24 
 
 		 457 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  24 
 
 		 451 aa  50.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  29.63 
 
 		 348 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  24.92 
 
 		 457 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  26.24 
 
 		 945 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  26 
 
 		 972 aa  50.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.35 
 
 		 769 aa  49.7  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  37.63 
 
 		 664 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  26.87 
 
 		 399 aa  48.9  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  23.34 
 
 		 458 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0571  Outer membrane autotransporter barrel  27.01 
 
 		 452 aa  48.5  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  29.61 
 
 		 452 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  37.38 
 
 		 1459 aa  48.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  26.73 
 
 		 396 aa  47.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  31.33 
 
 		 629 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  26.15 
 
 		 384 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  28.25 
 
 		 454 aa  47.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  27.75 
 
 		 629 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  24.06 
 
 		 441 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  36.45 
 
 		 1458 aa  47  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  27.95 
 
 		 646 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  24.06 
 
 		 441 aa  47  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  29.41 
 
 		 381 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  28.57 
 
 		 646 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  28.23 
 
 		 2396 aa  45.8  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  29.8 
 
 		 1012 aa  46.2  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  32.59 
 
 		 379 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  37.5 
 
 		 607 aa  44.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  29.82 
 
 		 1056 aa  44.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  24.11 
 
 		 376 aa  44.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  27.27 
 
 		 448 aa  44.3  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>