73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1343 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  55.46 
 
 
723 aa  756    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  56.5 
 
 
720 aa  809    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  71.1 
 
 
731 aa  1026    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  61.31 
 
 
729 aa  870    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  100 
 
 
732 aa  1467    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  63.64 
 
 
733 aa  922    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  53.34 
 
 
723 aa  723    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  94.81 
 
 
732 aa  1379    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  57.06 
 
 
721 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  55.74 
 
 
723 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  54.42 
 
 
719 aa  739    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  61.59 
 
 
729 aa  877    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  42.74 
 
 
754 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  42.74 
 
 
754 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  41.58 
 
 
760 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  40.82 
 
 
793 aa  461  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  39.59 
 
 
775 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  39.94 
 
 
776 aa  452  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  37.3 
 
 
423 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  26.7 
 
 
498 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  26.94 
 
 
501 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.22 
 
 
1641 aa  73.9  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.77 
 
 
1641 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  24.77 
 
 
575 aa  71.6  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  34.19 
 
 
506 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  24.57 
 
 
624 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  24.57 
 
 
624 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  24.11 
 
 
546 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  24.92 
 
 
624 aa  64.7  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  24.29 
 
 
624 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.29 
 
 
3977 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  23.87 
 
 
635 aa  60.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  27.13 
 
 
600 aa  58.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.58 
 
 
2701 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  24.01 
 
 
624 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  24.32 
 
 
624 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  24.32 
 
 
624 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  26.88 
 
 
633 aa  55.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  24.9 
 
 
627 aa  53.9  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  35.82 
 
 
1322 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  22.75 
 
 
624 aa  52.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.98 
 
 
429 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  38 
 
 
567 aa  52  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  31.43 
 
 
1355 aa  52  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  26.54 
 
 
390 aa  51.6  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  24.01 
 
 
624 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  26.15 
 
 
601 aa  51.2  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  31.34 
 
 
539 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  31.34 
 
 
539 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  34.81 
 
 
576 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  33.67 
 
 
551 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  23.17 
 
 
1587 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  37.84 
 
 
2852 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  24.08 
 
 
599 aa  48.9  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  26.35 
 
 
622 aa  49.3  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  33.68 
 
 
589 aa  48.9  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  33.57 
 
 
533 aa  48.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  24.74 
 
 
600 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
629 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  33.68 
 
 
589 aa  47.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  32.82 
 
 
598 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  31.01 
 
 
2182 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  29.9 
 
 
1175 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  31.52 
 
 
513 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  30.61 
 
 
438 aa  45.8  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  24.22 
 
 
857 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  30.86 
 
 
621 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  31.74 
 
 
513 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  31.52 
 
 
513 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  27.44 
 
 
513 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.5 
 
 
774 aa  44.3  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  27.65 
 
 
348 aa  44.3  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.82 
 
 
2796 aa  43.9  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>