81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4114 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  99.03 
 
 
513 aa  1041    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  97.86 
 
 
513 aa  1014    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  98.44 
 
 
513 aa  1038    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1050    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  57.24 
 
 
472 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  52.28 
 
 
456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  52.75 
 
 
461 aa  443  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  44.33 
 
 
438 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  41.12 
 
 
429 aa  267  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  38.68 
 
 
512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
1175 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  30.57 
 
 
438 aa  143  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  29.71 
 
 
470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  31.17 
 
 
451 aa  137  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  30.08 
 
 
454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  30.98 
 
 
457 aa  128  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  31.44 
 
 
453 aa  127  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  27.8 
 
 
998 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  30.28 
 
 
451 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  28.82 
 
 
510 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30 
 
 
1844 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  29.86 
 
 
453 aa  124  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  27.11 
 
 
699 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  33.65 
 
 
469 aa  104  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  27.79 
 
 
945 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  26.81 
 
 
526 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  27.88 
 
 
501 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  28.21 
 
 
501 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  31.17 
 
 
466 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  30.07 
 
 
494 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  27.59 
 
 
2852 aa  90.9  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  30.07 
 
 
504 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  31.05 
 
 
854 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  28.48 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  29.8 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.54 
 
 
3977 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  28.85 
 
 
495 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  28.04 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  27.8 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  27.68 
 
 
457 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  27.1 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 
489 aa  67.4  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  26.59 
 
 
486 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  21.21 
 
 
417 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 
1016 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  22.81 
 
 
390 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.48 
 
 
769 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
748 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  40.54 
 
 
624 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  27.67 
 
 
451 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  42.25 
 
 
624 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  42.25 
 
 
624 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  41.67 
 
 
624 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  40.54 
 
 
624 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  39.19 
 
 
624 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  39.19 
 
 
624 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  25.64 
 
 
452 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  26.24 
 
 
345 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  28.27 
 
 
490 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  22.26 
 
 
451 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  39.44 
 
 
624 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  27.85 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  25.89 
 
 
451 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  43.08 
 
 
624 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  37.5 
 
 
635 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  27.38 
 
 
760 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  27.93 
 
 
348 aa  47.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  24.07 
 
 
415 aa  47.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  24.81 
 
 
487 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  25.32 
 
 
454 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.65 
 
 
657 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  23.26 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  36.11 
 
 
616 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  24.65 
 
 
389 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  29.27 
 
 
732 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  27.44 
 
 
732 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  24.57 
 
 
379 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  31.63 
 
 
640 aa  43.9  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  22.01 
 
 
441 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  38.46 
 
 
627 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  25.86 
 
 
344 aa  43.5  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>