87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2135 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  64.12 
 
 		 635 aa  797    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  87.82 
 
 		 624 aa  1087    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  79.81 
 
 		 624 aa  1013    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  87.34 
 
 		 624 aa  1099    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  66.88 
 
 		 627 aa  785    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  81.73 
 
 		 624 aa  1050    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  82.21 
 
 		 624 aa  1028    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  88.62 
 
 		 624 aa  1111    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  82.37 
 
 		 624 aa  1034    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  100 
 
 		 624 aa  1267    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  88.3 
 
 		 624 aa  1109    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  42.38 
 
 		 621 aa  463  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  45.84 
 
 		 592 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  39.45 
 
 		 622 aa  422  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  39.79 
 
 		 600 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  44.53 
 
 		 533 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  39.97 
 
 		 600 aa  405  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  42.37 
 
 		 539 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  42.69 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  42.18 
 
 		 539 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  43.59 
 
 		 1355 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  41.3 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  43.04 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  41.7 
 
 		 857 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  40.43 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.15 
 
 		 774 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  40.67 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  39.68 
 
 		 622 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  38.94 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  38.96 
 
 		 589 aa  355  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  38.07 
 
 		 589 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  40.5 
 
 		 576 aa  351  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  42.08 
 
 		 1587 aa  347  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  38.92 
 
 		 1322 aa  340  5e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  36.84 
 
 		 575 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  37.5 
 
 		 498 aa  302  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  38.91 
 
 		 506 aa  293  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  39.15 
 
 		 501 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  33.63 
 
 		 599 aa  283  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  39.25 
 
 		 2701 aa  263  8e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  37.8 
 
 		 2182 aa  262  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.62 
 
 		 2796 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  49.2 
 
 		 1175 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.28 
 
 		 1795 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 3977 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  32.85 
 
 		 2852 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  25.1 
 
 		 423 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  45.05 
 
 		 748 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  23.45 
 
 		 776 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  25.22 
 
 		 775 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.22 
 
 		 1641 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 		 1641 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  32.32 
 
 		 616 aa  70.1  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  24.79 
 
 		 760 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  21.19 
 
 		 721 aa  68.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  24.11 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  23.94 
 
 		 733 aa  67.4  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  24.92 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  37.12 
 
 		 640 aa  67  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25.3 
 
 		 754 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  28.02 
 
 		 729 aa  65.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  28.5 
 
 		 729 aa  66.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  21.86 
 
 		 793 aa  64.3  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  22.14 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  22.11 
 
 		 723 aa  60.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  31.79 
 
 		 723 aa  60.1  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  23.31 
 
 		 732 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  21.3 
 
 		 719 aa  54.3  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.45 
 
 		 354 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  22.66 
 
 		 732 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 		 334 aa  50.8  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.57 
 
 		 347 aa  50.4  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.16 
 
 		 348 aa  50.4  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.31 
 
 		 338 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  43.08 
 
 		 513 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  39.19 
 
 		 513 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  23.69 
 
 		 731 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.32 
 
 		 348 aa  48.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  41.54 
 
 		 513 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  41.54 
 
 		 513 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  21.24 
 
 		 721 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3524  hypothetical protein  47.73 
 
 		 370 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.76 
 
 		 354 aa  44.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.81 
 
 		 689 aa  44.3  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.84 
 
 		 311 aa  43.9  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.84 
 
 		 311 aa  43.9  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>