250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0580 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  100 
 
 		 748 aa  1482    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6734  5'-Nucleotidase domain protein  47.49 
 
 		 726 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3214  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.09 
 
 		 668 aa  551  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  46.57 
 
 		 1355 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  45.76 
 
 		 657 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  46.98 
 
 		 808 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  42.84 
 
 		 2667 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  43.24 
 
 		 2775 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  38.2 
 
 		 2796 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.68 
 
 		 980 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.57 
 
 		 3977 aa  359  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  37.68 
 
 		 2852 aa  357  5e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  34.18 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  31.97 
 
 		 619 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  31.97 
 
 		 619 aa  227  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.29 
 
 		 627 aa  184  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  28.11 
 
 		 659 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  30.81 
 
 		 520 aa  180  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  27.65 
 
 		 657 aa  180  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3844  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.96 
 
 		 712 aa  177  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.86 
 
 		 607 aa  170  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 605 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  27.82 
 
 		 638 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.83 
 
 		 663 aa  160  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  27.35 
 
 		 526 aa  158  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  31.03 
 
 		 619 aa  155  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.28 
 
 		 587 aa  153  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.45 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.8 
 
 		 555 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.65 
 
 		 523 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  28.97 
 
 		 523 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  27.95 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2776  5'-Nucleotidase domain protein  31.22 
 
 		 603 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  25.44 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  27.65 
 
 		 558 aa  138  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.3 
 
 		 601 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  28.71 
 
 		 581 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.92 
 
 		 672 aa  112  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  26.03 
 
 		 641 aa  107  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.7 
 
 		 508 aa  99  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.03 
 
 		 607 aa  98.2  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  25.09 
 
 		 637 aa  96.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  25.09 
 
 		 637 aa  95.5  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.04 
 
 		 508 aa  90.5  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.59 
 
 		 523 aa  90.5  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.04 
 
 		 508 aa  90.5  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  25.28 
 
 		 584 aa  88.6  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  27.08 
 
 		 664 aa  88.6  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  24.36 
 
 		 591 aa  86.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  26.65 
 
 		 1311 aa  84.3  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  28.24 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  29.93 
 
 		 625 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  24.53 
 
 		 504 aa  83.2  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2272  5'-Nucleotidase domain protein  23.41 
 
 		 698 aa  80.9  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  23.93 
 
 		 607 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  48.89 
 
 		 624 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  48.89 
 
 		 624 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  48.89 
 
 		 624 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  48.89 
 
 		 624 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  46.88 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  45.05 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  46.24 
 
 		 627 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  25.32 
 
 		 580 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  45.56 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  45.56 
 
 		 624 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  45.56 
 
 		 624 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.93 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  43.62 
 
 		 624 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  22.72 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.24 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.94 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  43.75 
 
 		 616 aa  73.9  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  24.66 
 
 		 559 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.3 
 
 		 578 aa  73.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  21.89 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  24.58 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  25.59 
 
 		 556 aa  72  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0193  5'-Nucleotidase domain protein  25.05 
 
 		 647 aa  70.1  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  24.96 
 
 		 1506 aa  70.5  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3996  metallophosphoesterase  24.3 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0615  5'-Nucleotidase domain protein  22.47 
 
 		 700 aa  69.7  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  26.51 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2309  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.16 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  24.36 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.48 
 
 		 722 aa  68.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  23.85 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  22.91 
 
 		 529 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  26.81 
 
 		 578 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.84 
 
 		 581 aa  67  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  25.05 
 
 		 655 aa  66.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  23.53 
 
 		 583 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  23.34 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3032  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.21 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0289029  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  24.8 
 
 		 560 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  22.75 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  22.61 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  24.72 
 
 		 602 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  24.26 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  22.56 
 
 		 586 aa  65.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.91 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>