71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1753 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  59.18 
 
 
729 aa  817    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  46.34 
 
 
754 aa  656    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  66.8 
 
 
720 aa  950    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  98.76 
 
 
723 aa  1419    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  80.31 
 
 
721 aa  1176    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  58.76 
 
 
729 aa  808    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  62.8 
 
 
731 aa  857    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  58.68 
 
 
719 aa  828    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  57.24 
 
 
733 aa  820    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  55.99 
 
 
732 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  59.61 
 
 
723 aa  859    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  46.29 
 
 
760 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  55.71 
 
 
732 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  100 
 
 
723 aa  1439    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  46.21 
 
 
754 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  43.24 
 
 
776 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  41.21 
 
 
793 aa  464  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  42.88 
 
 
775 aa  465  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  39.58 
 
 
423 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  29.06 
 
 
498 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  26.79 
 
 
501 aa  114  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.75 
 
 
1641 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.55 
 
 
1641 aa  101  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  25.74 
 
 
1587 aa  88.2  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  23.76 
 
 
546 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  35.9 
 
 
506 aa  81.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  24.01 
 
 
575 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.66 
 
 
3977 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.81 
 
 
2701 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  25.3 
 
 
624 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  25 
 
 
624 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  34.29 
 
 
551 aa  68.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  22.79 
 
 
624 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  24.56 
 
 
627 aa  65.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  25 
 
 
624 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  22.55 
 
 
624 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  24.47 
 
 
624 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.88 
 
 
774 aa  65.1  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  23.67 
 
 
624 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  24.49 
 
 
857 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  32.37 
 
 
1355 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  31.37 
 
 
633 aa  63.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  24.7 
 
 
635 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  34.06 
 
 
533 aa  62.4  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  32.74 
 
 
2852 aa  60.8  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  23.12 
 
 
624 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
2182 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  31.82 
 
 
622 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  33.59 
 
 
539 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  33.59 
 
 
539 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  35.35 
 
 
599 aa  58.2  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  32.67 
 
 
2796 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  26.53 
 
 
598 aa  57.8  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  32.84 
 
 
576 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  25 
 
 
600 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  31.08 
 
 
1322 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  23.14 
 
 
592 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  34.74 
 
 
567 aa  55.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
629 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  28.99 
 
 
600 aa  54.7  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  27.59 
 
 
589 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  25.33 
 
 
601 aa  52  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  30.43 
 
 
621 aa  51.6  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  33.72 
 
 
624 aa  50.8  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  29.69 
 
 
451 aa  50.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  28.87 
 
 
589 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  27.33 
 
 
453 aa  47.8  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
1795 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  25.18 
 
 
1175 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  31.4 
 
 
622 aa  45.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  25.65 
 
 
721 aa  44.3  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>