67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1758 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  100 
 
 
621 aa  1256    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  66.02 
 
 
622 aa  855    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  43.45 
 
 
600 aa  482  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  44.19 
 
 
635 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  42.28 
 
 
627 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  44.62 
 
 
624 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  41.64 
 
 
624 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  42.07 
 
 
624 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  42.38 
 
 
624 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  41.92 
 
 
624 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  41.77 
 
 
624 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  41.77 
 
 
624 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  41.82 
 
 
624 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  42.12 
 
 
624 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
629 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  42.36 
 
 
592 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.58 
 
 
774 aa  349  8e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  37.33 
 
 
533 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  36.51 
 
 
551 aa  347  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  40.95 
 
 
546 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  38.7 
 
 
857 aa  339  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  36.06 
 
 
600 aa  333  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  38.38 
 
 
1355 aa  332  9e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  37.56 
 
 
589 aa  332  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  38.52 
 
 
539 aa  329  9e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  33.92 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  36.38 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  38.34 
 
 
539 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  35.75 
 
 
633 aa  323  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  38.15 
 
 
598 aa  323  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  39.06 
 
 
1587 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  38.62 
 
 
589 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  36.54 
 
 
576 aa  313  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  37.52 
 
 
601 aa  306  9.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  36.13 
 
 
575 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  35.07 
 
 
1322 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  31.55 
 
 
599 aa  253  8.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  36.43 
 
 
501 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  32.25 
 
 
506 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  32.68 
 
 
498 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.5 
 
 
2701 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  44.17 
 
 
1175 aa  218  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  30.08 
 
 
2796 aa  203  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  32.43 
 
 
2182 aa  201  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.01 
 
 
1795 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  31.21 
 
 
2852 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.49 
 
 
3977 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.74 
 
 
1641 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.54 
 
 
1641 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  23.68 
 
 
423 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25.27 
 
 
754 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  25.27 
 
 
754 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  28.64 
 
 
775 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  39.51 
 
 
733 aa  56.2  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  35.16 
 
 
723 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  19.96 
 
 
721 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  36.9 
 
 
760 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  30.43 
 
 
723 aa  51.6  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  30.43 
 
 
723 aa  51.6  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  23.94 
 
 
776 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  33.72 
 
 
720 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  31.4 
 
 
719 aa  48.9  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  32.1 
 
 
732 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  30.86 
 
 
732 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  31.76 
 
 
721 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  27.93 
 
 
387 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  42.65 
 
 
612 aa  43.9  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>