142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1474 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  60.27 
 
 		 631 aa  696    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1250    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  87.18 
 
 		 624 aa  1113    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  37.48 
 
 		 626 aa  346  8e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  32.44 
 
 		 884 aa  266  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  31.63 
 
 		 883 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  29.6 
 
 		 887 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  29.41 
 
 		 583 aa  166  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  32.05 
 
 		 630 aa  161  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  33.26 
 
 		 625 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  27.86 
 
 		 607 aa  141  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  27.5 
 
 		 648 aa  135  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  29.33 
 
 		 673 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  29.72 
 
 		 653 aa  133  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  28.67 
 
 		 653 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  28 
 
 		 630 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  29.26 
 
 		 653 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  28.74 
 
 		 654 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  29.49 
 
 		 653 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  29.26 
 
 		 653 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  27.82 
 
 		 654 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  27.45 
 
 		 623 aa  128  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  28.28 
 
 		 652 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  27.59 
 
 		 678 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  27.59 
 
 		 678 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  27.23 
 
 		 688 aa  127  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  29.03 
 
 		 653 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  29.03 
 
 		 653 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  29.03 
 
 		 653 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  28.28 
 
 		 651 aa  127  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  29.03 
 
 		 653 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  27.75 
 
 		 650 aa  124  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  27.93 
 
 		 678 aa  121  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  28.07 
 
 		 631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  28.3 
 
 		 662 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  27.62 
 
 		 650 aa  118  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  27.29 
 
 		 650 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  27.8 
 
 		 651 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  28.77 
 
 		 696 aa  70.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  27.19 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  30.48 
 
 		 639 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  29.27 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 		 633 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  27.94 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  27.2 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  30.41 
 
 		 629 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  30.37 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  30.37 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  27.96 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  26.46 
 
 		 587 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  28.06 
 
 		 715 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  26.27 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  26.92 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  29.8 
 
 		 674 aa  58.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  29.05 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  26.23 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  32.58 
 
 		 632 aa  57.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  27.89 
 
 		 596 aa  57  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  27.18 
 
 		 642 aa  57  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  29.65 
 
 		 702 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  26.37 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  28.95 
 
 		 663 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  30.52 
 
 		 786 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  27.17 
 
 		 642 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  32.39 
 
 		 691 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  27.36 
 
 		 698 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  26.7 
 
 		 695 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  25.75 
 
 		 372 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  29.01 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  28.26 
 
 		 702 aa  55.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  30.11 
 
 		 699 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  30.11 
 
 		 699 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  30.11 
 
 		 699 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  28.24 
 
 		 672 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  25.21 
 
 		 377 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  26.13 
 
 		 383 aa  54.3  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  30.37 
 
 		 674 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  27.43 
 
 		 662 aa  53.9  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  28.41 
 
 		 718 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  29.7 
 
 		 689 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  27.96 
 
 		 634 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  27.87 
 
 		 672 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  25.85 
 
 		 704 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  28.14 
 
 		 689 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  29.55 
 
 		 697 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  55.81 
 
 		 622 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  29.94 
 
 		 689 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  28.87 
 
 		 630 aa  51.6  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  27.91 
 
 		 708 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 		 686 aa  51.2  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  30.81 
 
 		 694 aa  51.6  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  27.93 
 
 		 647 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  29.71 
 
 		 744 aa  51.6  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3179  protein of unknown function DUF839  32.73 
 
 		 818 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  26.04 
 
 		 435 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  24.77 
 
 		 386 aa  50.8  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  22.37 
 
 		 386 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  27.75 
 
 		 677 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  31.29 
 
 		 651 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  30.16 
 
 		 690 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>