137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5379 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  61.61 
 
 
690 aa  853    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  54.79 
 
 
695 aa  752    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
699 aa  1432    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  51.06 
 
 
680 aa  638    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  57.34 
 
 
684 aa  791    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  100 
 
 
699 aa  1432    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  80.03 
 
 
691 aa  1147    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  55.36 
 
 
677 aa  719    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  49.37 
 
 
698 aa  648    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  99.43 
 
 
699 aa  1424    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  80.43 
 
 
690 aa  1152    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  53.16 
 
 
708 aa  678    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  52.56 
 
 
704 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  51.98 
 
 
694 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  55.38 
 
 
696 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  50.22 
 
 
693 aa  627  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  49.57 
 
 
674 aa  617  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  47.35 
 
 
689 aa  611  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  47.61 
 
 
708 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  48.09 
 
 
669 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  46 
 
 
744 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  47.95 
 
 
689 aa  570  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  46.82 
 
 
694 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  45.34 
 
 
821 aa  557  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  44.01 
 
 
702 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  47.5 
 
 
702 aa  546  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  47.16 
 
 
738 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  45.66 
 
 
689 aa  540  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  45.52 
 
 
715 aa  531  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  44.16 
 
 
647 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  44.21 
 
 
641 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  42.9 
 
 
647 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  43.91 
 
 
658 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  41.39 
 
 
667 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  44.18 
 
 
640 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  43.92 
 
 
628 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  38.68 
 
 
718 aa  445  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  43.83 
 
 
628 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  41.62 
 
 
663 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  41.5 
 
 
659 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  41.5 
 
 
659 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  40.29 
 
 
687 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  40.14 
 
 
663 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  41.61 
 
 
624 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  38.84 
 
 
674 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  36.31 
 
 
642 aa  397  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 
633 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  37.46 
 
 
642 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  36.93 
 
 
663 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  37.54 
 
 
639 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  37.54 
 
 
638 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  38.98 
 
 
634 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  38.49 
 
 
630 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  37.8 
 
 
629 aa  363  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  35.82 
 
 
632 aa  363  8e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  36.58 
 
 
681 aa  361  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  38.78 
 
 
638 aa  354  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  36.54 
 
 
627 aa  349  8e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  37.26 
 
 
619 aa  347  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  36.81 
 
 
593 aa  347  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  37.02 
 
 
593 aa  347  6e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  37.24 
 
 
593 aa  344  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  35.53 
 
 
662 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  34.99 
 
 
596 aa  342  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  37.05 
 
 
697 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  34.45 
 
 
625 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  34.52 
 
 
672 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  35.94 
 
 
672 aa  317  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  37.63 
 
 
651 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  33.85 
 
 
667 aa  310  9e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  35.92 
 
 
651 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  34.86 
 
 
695 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  33.69 
 
 
726 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  32.65 
 
 
685 aa  289  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  32.5 
 
 
678 aa  282  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  32.08 
 
 
678 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  31.31 
 
 
689 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  32.4 
 
 
685 aa  275  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  32.89 
 
 
716 aa  273  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  32.55 
 
 
685 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  32.36 
 
 
685 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  31.38 
 
 
685 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  31.38 
 
 
685 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  31.52 
 
 
685 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  31.67 
 
 
685 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  31.37 
 
 
685 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  31.52 
 
 
686 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  31.12 
 
 
686 aa  263  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  31.47 
 
 
733 aa  256  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  31.67 
 
 
687 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  32.09 
 
 
587 aa  252  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  30.81 
 
 
733 aa  251  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  31.03 
 
 
691 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  30.9 
 
 
691 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  30.9 
 
 
691 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 
716 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  30.79 
 
 
728 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  30.74 
 
 
753 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  31.14 
 
 
741 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  33.38 
 
 
826 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>