70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4291 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  66.84 
 
 
377 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  62.63 
 
 
389 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  64.6 
 
 
383 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  58.44 
 
 
383 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  63.31 
 
 
383 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  55.75 
 
 
386 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  57.91 
 
 
386 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  56.01 
 
 
386 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  56.16 
 
 
328 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  46.3 
 
 
369 aa  309  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  29.42 
 
 
444 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  31.68 
 
 
440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  32.29 
 
 
455 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  31.71 
 
 
587 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  30.77 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  28.91 
 
 
445 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  35.63 
 
 
484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  30.14 
 
 
471 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  28.28 
 
 
461 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  30.16 
 
 
499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  28.84 
 
 
422 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  28.57 
 
 
435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  31.21 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  30.89 
 
 
630 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  26.32 
 
 
442 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  27.02 
 
 
504 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  26.65 
 
 
494 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  26.95 
 
 
560 aa  69.7  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  27.27 
 
 
631 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  36.73 
 
 
587 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  25.75 
 
 
612 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  24.89 
 
 
624 aa  53.1  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  25.52 
 
 
442 aa  53.1  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  27.22 
 
 
633 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  29.32 
 
 
634 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  30.47 
 
 
624 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  27.78 
 
 
607 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  30.37 
 
 
693 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  26.29 
 
 
625 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  31.36 
 
 
739 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  23.6 
 
 
583 aa  47  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  43.08 
 
 
697 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  23.4 
 
 
593 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  23.4 
 
 
593 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.4 
 
 
593 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  27.69 
 
 
632 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  31.79 
 
 
628 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  27.13 
 
 
638 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  27.22 
 
 
639 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  41.3 
 
 
630 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  38.95 
 
 
687 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  32.58 
 
 
628 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  26.14 
 
 
596 aa  44.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  32.58 
 
 
640 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  25 
 
 
662 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  27.33 
 
 
694 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  28.11 
 
 
627 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  27.69 
 
 
681 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  28.18 
 
 
663 aa  43.5  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  24.37 
 
 
653 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  24.37 
 
 
653 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  24.37 
 
 
653 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  24.37 
 
 
653 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  23.53 
 
 
653 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  22.69 
 
 
653 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  25.64 
 
 
630 aa  42.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  38.18 
 
 
718 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  22.69 
 
 
653 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  22.69 
 
 
653 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>