64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3405 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 504 aa  1024    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  42.13 
 
 		 443 aa  300  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  35.88 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  31.84 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  32.2 
 
 		 422 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  33.08 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  36.74 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  35.61 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  32.71 
 
 		 494 aa  206  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  35.34 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  32.45 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  30.8 
 
 		 461 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  33.4 
 
 		 499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  31.19 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  28.91 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  27.96 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  27.34 
 
 		 386 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  27.98 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  27.72 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  30.81 
 
 		 383 aa  107  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  25.68 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  27.24 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  27.02 
 
 		 372 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  40.74 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  41.22 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  35.09 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.17 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  22.87 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  23.2 
 
 		 639 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  22.26 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  23.02 
 
 		 633 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  29.09 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  22.11 
 
 		 638 aa  57  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  31.78 
 
 		 630 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  27.61 
 
 		 634 aa  54.3  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  27.91 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  30.88 
 
 		 739 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  27.91 
 
 		 587 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  22.44 
 
 		 632 aa  51.2  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  27.07 
 
 		 629 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  27.78 
 
 		 697 aa  50.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  28.57 
 
 		 624 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 		 596 aa  49.7  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  31.37 
 
 		 663 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  31.54 
 
 		 630 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  23.86 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  29.25 
 
 		 693 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  26.57 
 
 		 726 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  31.4 
 
 		 663 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  29.55 
 
 		 638 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  27.74 
 
 		 631 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  29.81 
 
 		 628 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  31.36 
 
 		 674 aa  45.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  24.75 
 
 		 684 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  23.95 
 
 		 627 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  23.47 
 
 		 704 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  28.85 
 
 		 640 aa  43.9  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  32.11 
 
 		 695 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  55.88 
 
 		 716 aa  43.9  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  30.84 
 
 		 786 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  30.33 
 
 		 659 aa  43.5  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  30.33 
 
 		 659 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  22.87 
 
 		 694 aa  43.5  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4941  protein of unknown function DUF839  26.22 
 
 		 751 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>