87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0331 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  959    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  65.56 
 
 		 442 aa  618  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  57.46 
 
 		 445 aa  529  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  46.68 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  43.86 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  46.98 
 
 		 440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  40.39 
 
 		 422 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  39.83 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  35.79 
 
 		 458 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  34.73 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  37.87 
 
 		 499 aa  229  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  31.88 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  33.47 
 
 		 494 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  30.8 
 
 		 504 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  29.4 
 
 		 377 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  29.3 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  28.35 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  28.92 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  28.12 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  28.28 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  29.13 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  29.19 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  26.44 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  25.65 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  25 
 
 		 587 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  23.8 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  22.18 
 
 		 593 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  21.84 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  22.45 
 
 		 593 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  24.4 
 
 		 628 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  23.57 
 
 		 560 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  23.82 
 
 		 628 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  24.8 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  32.14 
 
 		 631 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  24.79 
 
 		 632 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  25.41 
 
 		 739 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  23.2 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  23.31 
 
 		 681 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  23.37 
 
 		 667 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  22.32 
 
 		 627 aa  60.1  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  23.58 
 
 		 629 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  21.43 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  21.95 
 
 		 633 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  23.16 
 
 		 596 aa  57  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  29.94 
 
 		 693 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  29.01 
 
 		 612 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  23.06 
 
 		 638 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  25.11 
 
 		 476 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  23.99 
 
 		 663 aa  53.5  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  24.06 
 
 		 663 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  22.85 
 
 		 634 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  24.47 
 
 		 587 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  24.47 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  28.31 
 
 		 659 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  28.74 
 
 		 786 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  21.22 
 
 		 697 aa  51.2  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  27.54 
 
 		 659 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  24.94 
 
 		 651 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  27.61 
 
 		 624 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  20.97 
 
 		 625 aa  50.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  22.9 
 
 		 658 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  20.47 
 
 		 638 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  23.67 
 
 		 651 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  25.47 
 
 		 755 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  30.41 
 
 		 642 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  33.59 
 
 		 687 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  24.1 
 
 		 630 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  27.63 
 
 		 625 aa  47.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  29.58 
 
 		 674 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  20.72 
 
 		 708 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  25.62 
 
 		 669 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  32.09 
 
 		 702 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  23.29 
 
 		 753 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  28.26 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  21.4 
 
 		 689 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  27.7 
 
 		 715 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  27.45 
 
 		 663 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  23.05 
 
 		 689 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  22.85 
 
 		 744 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  22.73 
 
 		 630 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  28.03 
 
 		 738 aa  44.3  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  20 
 
 		 704 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01880  hypothetical protein  48.65 
 
 		 59 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0620903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  21.83 
 
 		 662 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  68 
 
 		 718 aa  43.9  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  30.53 
 
 		 821 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  28.67 
 
 		 674 aa  43.5  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>