32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1320 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  732    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  55.72 
 
 
377 aa  348  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  47.64 
 
 
389 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  46.3 
 
 
372 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  44.74 
 
 
383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  51.4 
 
 
328 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  45.14 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  44.24 
 
 
386 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  44.25 
 
 
386 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  44.74 
 
 
383 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  40.62 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  29.74 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  27.9 
 
 
422 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  27.35 
 
 
435 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  27.87 
 
 
440 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  29.59 
 
 
444 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  26.7 
 
 
442 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  25.65 
 
 
461 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  34.72 
 
 
458 aa  92  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  32.35 
 
 
443 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  26.92 
 
 
455 aa  89.7  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  26.92 
 
 
587 aa  89.4  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  27 
 
 
445 aa  87.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  29.71 
 
 
499 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  40.74 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  28.49 
 
 
471 aa  82  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  27.69 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  25.32 
 
 
630 aa  63.2  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  40.91 
 
 
631 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  35.71 
 
 
587 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  25.53 
 
 
560 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  23.94 
 
 
612 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>