43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34273 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  100 
 
 
630 aa  1316    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  73.39 
 
 
587 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  73.39 
 
 
455 aa  514  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  29.7 
 
 
386 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  30.89 
 
 
372 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  30.28 
 
 
386 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  30.12 
 
 
386 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  30.67 
 
 
383 aa  98.2  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  29.3 
 
 
377 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  31.85 
 
 
389 aa  96.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  30.03 
 
 
383 aa  94  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  27.3 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  27.41 
 
 
328 aa  76.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  25.32 
 
 
369 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  32.28 
 
 
145 aa  63.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  25.08 
 
 
444 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  27.27 
 
 
443 aa  57.4  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 
504 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  27.27 
 
 
151 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  25.15 
 
 
440 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  31.11 
 
 
484 aa  51.6  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  32.48 
 
 
458 aa  50.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  23.12 
 
 
422 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0008  OsmC family protein  35.29 
 
 
138 aa  48.9  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  28.87 
 
 
177 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  22.81 
 
 
435 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  38.3 
 
 
134 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  36.05 
 
 
171 aa  48.5  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  31.9 
 
 
445 aa  47.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  31.67 
 
 
189 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  24.1 
 
 
461 aa  47.8  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  32.21 
 
 
176 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  37.23 
 
 
135 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  32.67 
 
 
134 aa  47.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0008  OsmC family protein  33.82 
 
 
138 aa  47  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0851  OsmC family protein  48.94 
 
 
141 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265109  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  33.33 
 
 
182 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0549  OsmC family protein  41.38 
 
 
147 aa  45.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  33.33 
 
 
182 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  22.57 
 
 
442 aa  44.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  31.01 
 
 
135 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  31.5 
 
 
407 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  32.91 
 
 
140 aa  44.3  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000280458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>