79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1288 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  62.37 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  60.88 
 
 		 386 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  61.14 
 
 		 386 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  64.25 
 
 		 383 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  56.07 
 
 		 383 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  62.69 
 
 		 383 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  58.76 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  56.01 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  49.42 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  44.24 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  35.71 
 
 		 444 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  32.98 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  31.11 
 
 		 440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  33.01 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  30.41 
 
 		 422 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  28.95 
 
 		 435 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  29.54 
 
 		 455 aa  123  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  29.47 
 
 		 587 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  31.74 
 
 		 471 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  30.74 
 
 		 442 aa  116  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  31.44 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  31.46 
 
 		 499 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  27.24 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  26.44 
 
 		 461 aa  99.4  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  30.12 
 
 		 630 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  28.73 
 
 		 445 aa  97.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 		 494 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  27.19 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  25.24 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  28.42 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  23.47 
 
 		 624 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  28.57 
 
 		 607 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  37.11 
 
 		 587 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  33.68 
 
 		 630 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  30.72 
 
 		 739 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  22.37 
 
 		 612 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  23.21 
 
 		 593 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.21 
 
 		 593 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  28.33 
 
 		 583 aa  49.7  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  22.62 
 
 		 593 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  46.67 
 
 		 697 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  26.36 
 
 		 625 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  24.79 
 
 		 462 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  25.4 
 
 		 630 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  27.59 
 
 		 629 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  24.64 
 
 		 651 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  26.19 
 
 		 653 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  26.5 
 
 		 654 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  24.64 
 
 		 653 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  26.5 
 
 		 654 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  24.64 
 
 		 652 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  29.14 
 
 		 633 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  26.5 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  26.19 
 
 		 653 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  26.5 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  26.19 
 
 		 653 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  26.19 
 
 		 653 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  26.5 
 
 		 650 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  24.43 
 
 		 648 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  25.4 
 
 		 650 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  29.31 
 
 		 626 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  27.56 
 
 		 638 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  30.6 
 
 		 628 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  27.98 
 
 		 642 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  24.6 
 
 		 653 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  25.64 
 
 		 653 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  24.6 
 
 		 653 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  24.6 
 
 		 653 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  28.97 
 
 		 639 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  24.11 
 
 		 678 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  34.15 
 
 		 628 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  21.99 
 
 		 651 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  29.92 
 
 		 634 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  31.65 
 
 		 640 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5068  protein of unknown function DUF839  25.83 
 
 		 463 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762163 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  27.01 
 
 		 663 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 		 658 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  25 
 
 		 663 aa  43.1  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>