32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0392 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  661    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  56.16 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  55.69 
 
 
377 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  53.67 
 
 
389 aa  319  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  48.36 
 
 
383 aa  305  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  51.4 
 
 
369 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  47.66 
 
 
386 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  49.42 
 
 
386 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  51.32 
 
 
383 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  48.4 
 
 
386 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  49.26 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  28.5 
 
 
440 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  27.82 
 
 
471 aa  92.4  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  26.27 
 
 
444 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  27.92 
 
 
458 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  27.17 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  29.22 
 
 
443 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  27.32 
 
 
587 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  24.48 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  24.22 
 
 
435 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  25.84 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  27.41 
 
 
630 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  23.8 
 
 
461 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  33.18 
 
 
484 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  28.77 
 
 
499 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  41.22 
 
 
504 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  31.34 
 
 
445 aa  69.7  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  26.15 
 
 
494 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  43.55 
 
 
631 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  23.7 
 
 
624 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  31.25 
 
 
587 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  22.75 
 
 
612 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>