67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2162 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  100 
 
 
389 aa  787    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  68.73 
 
 
383 aa  488  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  64.08 
 
 
386 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  65.27 
 
 
383 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  64.25 
 
 
377 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  61.24 
 
 
386 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  62.37 
 
 
386 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  67.18 
 
 
383 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  62.63 
 
 
372 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  53.67 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  47.64 
 
 
369 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  32.25 
 
 
444 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  33.06 
 
 
471 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  32.93 
 
 
440 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  31.31 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  33.55 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  31.23 
 
 
422 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  32.47 
 
 
455 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  31.76 
 
 
443 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  28.92 
 
 
461 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  32.47 
 
 
587 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  33.63 
 
 
499 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  30.38 
 
 
458 aa  117  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  28.47 
 
 
442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  27.72 
 
 
504 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  29.28 
 
 
445 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  26.5 
 
 
494 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  31.85 
 
 
630 aa  96.7  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  29.25 
 
 
560 aa  77.4  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  29.32 
 
 
631 aa  67  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  26.74 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  23.44 
 
 
587 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  29.81 
 
 
607 aa  51.2  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  25.22 
 
 
624 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  24.35 
 
 
612 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  31.58 
 
 
640 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  30.16 
 
 
624 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  28.33 
 
 
583 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  24.16 
 
 
593 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  45 
 
 
697 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  26.52 
 
 
625 aa  47  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  29.84 
 
 
634 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  24.16 
 
 
593 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  24.16 
 
 
593 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  32.24 
 
 
628 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  25.46 
 
 
663 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  26.77 
 
 
630 aa  46.6  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  28.35 
 
 
639 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  33.59 
 
 
628 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  28.35 
 
 
638 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  28.14 
 
 
663 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  27.91 
 
 
625 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  25 
 
 
654 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  33.63 
 
 
642 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  25 
 
 
654 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  30.16 
 
 
632 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  32.11 
 
 
739 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  38.82 
 
 
691 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  25 
 
 
678 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  25 
 
 
678 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  26.54 
 
 
659 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  26.54 
 
 
659 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  38.82 
 
 
691 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  44.07 
 
 
691 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  29.17 
 
 
674 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
627 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  27.64 
 
 
663 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>