134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2555 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  62.97 
 
 		 625 aa  776    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 627 aa  1295    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  53.28 
 
 		 632 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  47.21 
 
 		 624 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  44.22 
 
 		 681 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  45.61 
 
 		 633 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  46.02 
 
 		 639 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  45.54 
 
 		 638 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  44.03 
 
 		 629 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  46.88 
 
 		 634 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  41.65 
 
 		 593 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  42.14 
 
 		 593 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  41.82 
 
 		 593 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  42.41 
 
 		 596 aa  449  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  39.64 
 
 		 697 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  40.95 
 
 		 651 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  39.72 
 
 		 630 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  40.16 
 
 		 619 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  39.41 
 
 		 658 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  38.85 
 
 		 647 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  40.07 
 
 		 638 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  37.89 
 
 		 662 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  38.47 
 
 		 647 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  39.7 
 
 		 672 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  39.37 
 
 		 672 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  39.8 
 
 		 663 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  36.54 
 
 		 726 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  36.84 
 
 		 695 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  36.8 
 
 		 667 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  38.35 
 
 		 667 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  38.02 
 
 		 689 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  37.95 
 
 		 680 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  37.91 
 
 		 651 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  37.24 
 
 		 695 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  38.69 
 
 		 628 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  38.97 
 
 		 677 aa  362  9e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  38.1 
 
 		 628 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  36.69 
 
 		 702 aa  362  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  38.21 
 
 		 689 aa  361  3e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  36.52 
 
 		 641 aa  359  9e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  36.85 
 
 		 687 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  37.38 
 
 		 640 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  36.9 
 
 		 694 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  37.24 
 
 		 691 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  35.04 
 
 		 718 aa  356  8.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  37.04 
 
 		 693 aa  354  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  36.74 
 
 		 663 aa  353  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  36.8 
 
 		 696 aa  353  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  36.5 
 
 		 699 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  37.04 
 
 		 674 aa  352  8.999999999999999e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  34.56 
 
 		 642 aa  351  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  36.54 
 
 		 699 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  36.54 
 
 		 699 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  35.22 
 
 		 659 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  35.07 
 
 		 659 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  37.24 
 
 		 690 aa  346  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  37.81 
 
 		 708 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  35.19 
 
 		 678 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  34.33 
 
 		 685 aa  340  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  34.69 
 
 		 733 aa  340  5e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  34.44 
 
 		 674 aa  340  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  34.78 
 
 		 733 aa  339  8e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  34.43 
 
 		 685 aa  339  9e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  34.43 
 
 		 685 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  37.15 
 
 		 669 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  34.63 
 
 		 678 aa  337  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  36.82 
 
 		 684 aa  336  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  33.11 
 
 		 728 aa  336  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  35.08 
 
 		 690 aa  336  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  37.44 
 
 		 704 aa  333  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  34.14 
 
 		 685 aa  331  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  37.28 
 
 		 738 aa  332  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  33.95 
 
 		 685 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  35.19 
 
 		 698 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  33.57 
 
 		 685 aa  327  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  33.47 
 
 		 685 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  33.43 
 
 		 686 aa  324  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  34.11 
 
 		 663 aa  324  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  33 
 
 		 685 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  36.01 
 
 		 702 aa  320  7e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  33.05 
 
 		 685 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  34.14 
 
 		 687 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  34.23 
 
 		 691 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  32.48 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  33.62 
 
 		 686 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  33.95 
 
 		 691 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  34.14 
 
 		 642 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  34.23 
 
 		 691 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  34.15 
 
 		 708 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  34.55 
 
 		 744 aa  310  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  36.55 
 
 		 689 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  34.95 
 
 		 694 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  33.98 
 
 		 755 aa  306  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  32.06 
 
 		 764 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  31.98 
 
 		 753 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  34.49 
 
 		 821 aa  295  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  33.1 
 
 		 716 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  31.7 
 
 		 741 aa  292  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  33.53 
 
 		 826 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  35.77 
 
 		 715 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>