148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0309 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  57.88 
 
 
689 aa  757    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  54.09 
 
 
690 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  51.22 
 
 
738 aa  653    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  53.68 
 
 
744 aa  695    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  51.06 
 
 
699 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
680 aa  1386    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  58.32 
 
 
677 aa  751    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  54.29 
 
 
698 aa  729    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  57.93 
 
 
695 aa  755    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  51.04 
 
 
689 aa  637    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  50.43 
 
 
702 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  51.06 
 
 
699 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  51.08 
 
 
691 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  58.27 
 
 
696 aa  777    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  55.23 
 
 
693 aa  668    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  50.64 
 
 
699 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  51.29 
 
 
690 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  56.94 
 
 
708 aa  766    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  57.7 
 
 
674 aa  741    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  60.75 
 
 
694 aa  804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  55.7 
 
 
669 aa  675    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  58.69 
 
 
704 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  49.92 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  49.47 
 
 
647 aa  612  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  50.78 
 
 
641 aa  608  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  48.1 
 
 
708 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  50 
 
 
715 aa  596  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  46.73 
 
 
684 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  47.93 
 
 
689 aa  591  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  47.23 
 
 
694 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  51 
 
 
702 aa  579  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  48.21 
 
 
821 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  47.46 
 
 
658 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  45.21 
 
 
718 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  48.87 
 
 
628 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  45.6 
 
 
663 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  47.81 
 
 
628 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  45.05 
 
 
687 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  44.05 
 
 
667 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  45.17 
 
 
659 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  50 
 
 
640 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  45.13 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  44.96 
 
 
659 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  43.47 
 
 
674 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  39.55 
 
 
642 aa  465  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  43.87 
 
 
642 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  40.71 
 
 
681 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  42.3 
 
 
663 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  41.43 
 
 
662 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  40.52 
 
 
639 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  40.24 
 
 
638 aa  429  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  43.33 
 
 
619 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  44.48 
 
 
630 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  39.75 
 
 
633 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  39.54 
 
 
632 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  42.39 
 
 
629 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  41.97 
 
 
672 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  40.41 
 
 
667 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  40.92 
 
 
672 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  39.45 
 
 
697 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  40.61 
 
 
634 aa  395  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  41.57 
 
 
638 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  38.85 
 
 
624 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  36.76 
 
 
726 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  37.42 
 
 
593 aa  379  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  37.95 
 
 
627 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  39.14 
 
 
651 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  36.52 
 
 
596 aa  378  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  37.11 
 
 
593 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  40.06 
 
 
651 aa  379  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  37.11 
 
 
593 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  37.71 
 
 
625 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  37.04 
 
 
695 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  35.32 
 
 
686 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  33.91 
 
 
689 aa  326  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  33.29 
 
 
733 aa  325  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  34.09 
 
 
685 aa  324  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  35.89 
 
 
716 aa  323  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  34.43 
 
 
685 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  34.34 
 
 
685 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  34.34 
 
 
685 aa  320  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  33.81 
 
 
685 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  33.86 
 
 
685 aa  317  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  34.19 
 
 
685 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  34.62 
 
 
685 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  34.29 
 
 
685 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  35.09 
 
 
678 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  34.45 
 
 
678 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  32.64 
 
 
733 aa  310  6.999999999999999e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  33.66 
 
 
686 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  33.53 
 
 
587 aa  306  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  35.05 
 
 
716 aa  301  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  32.47 
 
 
728 aa  293  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  33.42 
 
 
741 aa  290  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  30.98 
 
 
755 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  32.49 
 
 
764 aa  287  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  31.85 
 
 
691 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  31.49 
 
 
691 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  31.71 
 
 
691 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  31.93 
 
 
687 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>