135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4794 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  100 
 
 		 690 aa  1419    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  62.14 
 
 		 684 aa  862    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  59 
 
 		 677 aa  779    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  61.61 
 
 		 699 aa  853    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  54.09 
 
 		 680 aa  663    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  52.94 
 
 		 693 aa  651    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  53.27 
 
 		 694 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  57.75 
 
 		 696 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  61.61 
 
 		 699 aa  853    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  62.55 
 
 		 691 aa  843    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  61.61 
 
 		 699 aa  854    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  62.93 
 
 		 690 aa  854    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  50.49 
 
 		 708 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  51.19 
 
 		 704 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  56.25 
 
 		 695 aa  754    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  49.37 
 
 		 698 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  49.58 
 
 		 689 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  50 
 
 		 674 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  48.06 
 
 		 744 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  50.07 
 
 		 669 aa  588  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  47.5 
 
 		 708 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  48.41 
 
 		 689 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  47.3 
 
 		 694 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  46.66 
 
 		 702 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  46.06 
 
 		 738 aa  549  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  46.62 
 
 		 689 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  47.31 
 
 		 702 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  45.97 
 
 		 821 aa  525  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  45.73 
 
 		 715 aa  502  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  43.91 
 
 		 641 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  42.23 
 
 		 647 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  42.6 
 
 		 647 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  44.28 
 
 		 658 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  41.61 
 
 		 663 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  42.88 
 
 		 659 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  42.63 
 
 		 663 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  42.73 
 
 		 659 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  39.97 
 
 		 667 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  41.75 
 
 		 628 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  41.28 
 
 		 628 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  41.3 
 
 		 640 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  39.67 
 
 		 718 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  40.03 
 
 		 687 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  39.76 
 
 		 674 aa  412  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  38.46 
 
 		 642 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  38.57 
 
 		 663 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  37.71 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  38.78 
 
 		 624 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  37.09 
 
 		 632 aa  382  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  38.99 
 
 		 629 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  38 
 
 		 642 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  40.33 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  40.13 
 
 		 634 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  38.64 
 
 		 630 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  38.52 
 
 		 619 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 		 639 aa  360  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  37.19 
 
 		 638 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  36.69 
 
 		 625 aa  353  8e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  38.99 
 
 		 638 aa  349  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  35.08 
 
 		 627 aa  336  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  36.28 
 
 		 662 aa  333  7.000000000000001e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  36.96 
 
 		 672 aa  331  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  35.69 
 
 		 697 aa  324  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  36.21 
 
 		 672 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  34.71 
 
 		 593 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  34.86 
 
 		 593 aa  314  3.9999999999999997e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  35.2 
 
 		 651 aa  313  9e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  34.86 
 
 		 593 aa  312  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  34.43 
 
 		 596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  35.12 
 
 		 667 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  35.53 
 
 		 695 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  35.58 
 
 		 651 aa  290  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  33.05 
 
 		 678 aa  290  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  32.53 
 
 		 685 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  32.34 
 
 		 685 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  31.86 
 
 		 685 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  32.24 
 
 		 685 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  32.06 
 
 		 685 aa  277  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  30.86 
 
 		 726 aa  277  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  32.58 
 
 		 678 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  31.77 
 
 		 685 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  31.68 
 
 		 685 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  31.77 
 
 		 685 aa  273  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  31.69 
 
 		 685 aa  273  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  32.98 
 
 		 753 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  31.85 
 
 		 686 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  30.04 
 
 		 689 aa  263  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  34.21 
 
 		 741 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  32.21 
 
 		 716 aa  259  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  31.02 
 
 		 733 aa  257  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  31.33 
 
 		 733 aa  257  6e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  32.26 
 
 		 691 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  31.5 
 
 		 686 aa  256  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  32.12 
 
 		 691 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  32.07 
 
 		 687 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  32.53 
 
 		 587 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  31.84 
 
 		 691 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  32.36 
 
 		 744 aa  251  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  32.11 
 
 		 716 aa  250  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  31.38 
 
 		 736 aa  244  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.371803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>