117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1942 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  57.86 
 
 		 691 aa  805    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  90.95 
 
 		 685 aa  1280    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  79.54 
 
 		 689 aa  1137    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  53.54 
 
 		 716 aa  707    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 685 aa  1418    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  99.12 
 
 		 685 aa  1409    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  78.17 
 
 		 686 aa  1100    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  96.93 
 
 		 685 aa  1359    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  74.49 
 
 		 686 aa  1063    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  90.07 
 
 		 685 aa  1251    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  89.2 
 
 		 685 aa  1290    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  57.86 
 
 		 691 aa  803    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  89.49 
 
 		 685 aa  1264    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  70.99 
 
 		 678 aa  1004    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  89.64 
 
 		 685 aa  1246    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  58.01 
 
 		 691 aa  805    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  59.02 
 
 		 687 aa  809    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  70.85 
 
 		 678 aa  1007    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  89.78 
 
 		 685 aa  1263    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  47.11 
 
 		 667 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  48.03 
 
 		 672 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  47.87 
 
 		 672 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  46.43 
 
 		 662 aa  545  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  42.01 
 
 		 716 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  42.57 
 
 		 728 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  42.07 
 
 		 733 aa  499  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  41.66 
 
 		 733 aa  483  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  42.78 
 
 		 695 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  40.55 
 
 		 753 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  40.62 
 
 		 764 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  40.69 
 
 		 741 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  41.74 
 
 		 744 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  41.92 
 
 		 755 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  39.84 
 
 		 736 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  39.56 
 
 		 681 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  41.27 
 
 		 826 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  41.2 
 
 		 651 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  40.46 
 
 		 651 aa  422  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  38.69 
 
 		 638 aa  415  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  39.8 
 
 		 630 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  40.59 
 
 		 619 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  37.43 
 
 		 697 aa  398  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  39.11 
 
 		 629 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  37.13 
 
 		 726 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  39.75 
 
 		 634 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  38.63 
 
 		 632 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  36.18 
 
 		 639 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  36.31 
 
 		 633 aa  365  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  38.3 
 
 		 624 aa  362  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  35.55 
 
 		 638 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  35.4 
 
 		 718 aa  350  5e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  35.57 
 
 		 593 aa  348  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  35.57 
 
 		 593 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  35.12 
 
 		 593 aa  345  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  34.43 
 
 		 627 aa  339  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  35.19 
 
 		 647 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  36.12 
 
 		 647 aa  336  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  34.19 
 
 		 658 aa  328  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  35.53 
 
 		 663 aa  327  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  34.05 
 
 		 642 aa  325  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  34.26 
 
 		 625 aa  323  5e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  34.02 
 
 		 641 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  34.92 
 
 		 659 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  34.92 
 
 		 659 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  33.48 
 
 		 667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  34.71 
 
 		 680 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  32.95 
 
 		 687 aa  310  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  34.34 
 
 		 596 aa  310  5e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  34.45 
 
 		 689 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  35.18 
 
 		 738 aa  304  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  34.03 
 
 		 698 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  32.49 
 
 		 663 aa  300  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  31.3 
 
 		 642 aa  296  6e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  34.23 
 
 		 628 aa  296  7e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  33.44 
 
 		 628 aa  296  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  34.07 
 
 		 694 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  34.13 
 
 		 640 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  33.48 
 
 		 674 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  33.24 
 
 		 695 aa  287  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  33.99 
 
 		 674 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  33.14 
 
 		 691 aa  283  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  34.44 
 
 		 677 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  33.93 
 
 		 708 aa  281  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  33.9 
 
 		 689 aa  280  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  33.54 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  32.89 
 
 		 690 aa  278  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 		 699 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  33.04 
 
 		 699 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  33.66 
 
 		 704 aa  274  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  31.68 
 
 		 690 aa  273  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  32.89 
 
 		 699 aa  273  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  31.35 
 
 		 821 aa  272  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  30.58 
 
 		 708 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  32.23 
 
 		 684 aa  270  8e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  33.77 
 
 		 694 aa  267  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  32.08 
 
 		 669 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  32.76 
 
 		 689 aa  263  8e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  32.88 
 
 		 715 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  32.18 
 
 		 744 aa  259  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  31.88 
 
 		 696 aa  256  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>