124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4059 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  100 
 
 		 651 aa  1343    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  46.13 
 
 		 633 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  47.99 
 
 		 624 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  46.32 
 
 		 639 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  44.7 
 
 		 681 aa  525  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  44.62 
 
 		 697 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  46.2 
 
 		 629 aa  521  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  45.23 
 
 		 638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  47.19 
 
 		 630 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  47.87 
 
 		 638 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  47.74 
 
 		 619 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  42.82 
 
 		 726 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  44.69 
 
 		 667 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  45.21 
 
 		 634 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  43.42 
 
 		 662 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  44.15 
 
 		 651 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  46.39 
 
 		 672 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  46.22 
 
 		 672 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  42.9 
 
 		 695 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  40.64 
 
 		 596 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  39.91 
 
 		 685 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  43.05 
 
 		 632 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  39.43 
 
 		 685 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  39.73 
 
 		 733 aa  433  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  40.46 
 
 		 685 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  40.17 
 
 		 685 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  39.91 
 
 		 686 aa  435  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  38.61 
 
 		 686 aa  435  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  39.53 
 
 		 716 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  39.74 
 
 		 685 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  40.31 
 
 		 593 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  39.71 
 
 		 685 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  40.31 
 
 		 593 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  42.19 
 
 		 641 aa  432  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  40.31 
 
 		 593 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  41.73 
 
 		 718 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  41.44 
 
 		 647 aa  429  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  39.69 
 
 		 733 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  40.33 
 
 		 658 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  40.75 
 
 		 647 aa  426  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  39.42 
 
 		 685 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  39.28 
 
 		 685 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  38.01 
 
 		 689 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  40.95 
 
 		 627 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  39.63 
 
 		 678 aa  419  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  39.4 
 
 		 685 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  41.86 
 
 		 625 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  38.05 
 
 		 678 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  40.83 
 
 		 663 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  36.93 
 
 		 687 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  38.15 
 
 		 755 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  40.53 
 
 		 687 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  39.53 
 
 		 663 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  40.09 
 
 		 659 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  38.47 
 
 		 764 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  40.03 
 
 		 659 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  36.69 
 
 		 753 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  36.2 
 
 		 691 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  37.28 
 
 		 744 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  38.12 
 
 		 663 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  35.59 
 
 		 691 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  37.93 
 
 		 667 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  36.02 
 
 		 691 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  40.06 
 
 		 680 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 		 716 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  36.85 
 
 		 741 aa  389  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  35.57 
 
 		 728 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  35.66 
 
 		 736 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  38.23 
 
 		 826 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  41.19 
 
 		 628 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  41.15 
 
 		 694 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  40.25 
 
 		 628 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  40.52 
 
 		 640 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  40.23 
 
 		 689 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  36.88 
 
 		 674 aa  363  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  39.29 
 
 		 677 aa  360  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  35.57 
 
 		 642 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  40.55 
 
 		 695 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  38.25 
 
 		 689 aa  348  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  38.04 
 
 		 696 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  37.48 
 
 		 642 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  39.32 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  38.55 
 
 		 708 aa  343  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  39.27 
 
 		 704 aa  343  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  36.05 
 
 		 698 aa  343  7e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  38.86 
 
 		 674 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  37.87 
 
 		 744 aa  333  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  36.18 
 
 		 738 aa  330  4e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  37.25 
 
 		 699 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  37.63 
 
 		 699 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  38.96 
 
 		 708 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  37.63 
 
 		 699 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  36.23 
 
 		 684 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  36.71 
 
 		 690 aa  323  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  37.35 
 
 		 702 aa  323  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  37.19 
 
 		 691 aa  320  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  39.79 
 
 		 702 aa  320  7e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  37.11 
 
 		 689 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  36.12 
 
 		 694 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  35.58 
 
 		 690 aa  306  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>