155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2111 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  63.15 
 
 		 630 aa  816    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1316    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  54.08 
 
 		 619 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  50.23 
 
 		 651 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  50.32 
 
 		 639 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  49.12 
 
 		 633 aa  569  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  49.92 
 
 		 638 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  49.27 
 
 		 681 aa  561  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  48.75 
 
 		 629 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  49.25 
 
 		 634 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  45.76 
 
 		 697 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  47.71 
 
 		 624 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  47.73 
 
 		 651 aa  524  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  48.11 
 
 		 662 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  43.21 
 
 		 726 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  49.67 
 
 		 672 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  46.97 
 
 		 667 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  49.18 
 
 		 672 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  44.8 
 
 		 695 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  43.47 
 
 		 658 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  43.03 
 
 		 632 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  41.31 
 
 		 678 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  40.75 
 
 		 596 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  41.11 
 
 		 678 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  41.31 
 
 		 593 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  41.95 
 
 		 593 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  42.42 
 
 		 663 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  41.21 
 
 		 593 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  44.89 
 
 		 647 aa  445  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  42.02 
 
 		 641 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  44.29 
 
 		 647 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  39.29 
 
 		 686 aa  435  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  39.66 
 
 		 685 aa  435  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  40.75 
 
 		 718 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  41.47 
 
 		 687 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  42.52 
 
 		 628 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  39.16 
 
 		 689 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  40.81 
 
 		 667 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  41.34 
 
 		 663 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  42.34 
 
 		 659 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  42.07 
 
 		 659 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  41.29 
 
 		 663 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  38.69 
 
 		 685 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  42.13 
 
 		 628 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  38.69 
 
 		 685 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  38.55 
 
 		 685 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  42.72 
 
 		 640 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  44.12 
 
 		 689 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  39.75 
 
 		 716 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  38.87 
 
 		 685 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  39.11 
 
 		 685 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  38.99 
 
 		 685 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  38.99 
 
 		 685 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  38.71 
 
 		 685 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  38.82 
 
 		 686 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  40.4 
 
 		 625 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  38.85 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  39.84 
 
 		 627 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  37.9 
 
 		 728 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  42.28 
 
 		 694 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  38.76 
 
 		 691 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  37.8 
 
 		 687 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  40.15 
 
 		 680 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  38.29 
 
 		 691 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  37.45 
 
 		 753 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  40.09 
 
 		 695 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  37.52 
 
 		 733 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  36.48 
 
 		 733 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  39.26 
 
 		 674 aa  382  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  37.11 
 
 		 744 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  39.83 
 
 		 826 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  42.53 
 
 		 674 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  37.46 
 
 		 698 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  38.81 
 
 		 755 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  41.03 
 
 		 708 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  38.9 
 
 		 696 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  38.69 
 
 		 744 aa  369  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  38.75 
 
 		 684 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  40.74 
 
 		 704 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  36.31 
 
 		 764 aa  365  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  38.58 
 
 		 716 aa  364  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  39.97 
 
 		 677 aa  363  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  38.18 
 
 		 642 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  38.3 
 
 		 699 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  38.88 
 
 		 690 aa  360  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  38 
 
 		 738 aa  359  7e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  38.99 
 
 		 690 aa  359  9e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  37.32 
 
 		 741 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  37.25 
 
 		 736 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  39.17 
 
 		 693 aa  355  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  38 
 
 		 699 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  38 
 
 		 699 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  38.47 
 
 		 669 aa  354  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  38.42 
 
 		 689 aa  353  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  38.44 
 
 		 691 aa  347  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  35.32 
 
 		 642 aa  346  7e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  38.73 
 
 		 689 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  38.1 
 
 		 708 aa  335  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  36.24 
 
 		 694 aa  331  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  37.13 
 
 		 821 aa  331  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>