117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1844 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  65.82 
 
 
764 aa  1010    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  68.93 
 
 
736 aa  1022    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  100 
 
 
744 aa  1517    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  61.97 
 
 
753 aa  926    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  55.43 
 
 
826 aa  679    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  60.79 
 
 
741 aa  895    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  51.89 
 
 
755 aa  699    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  48.46 
 
 
716 aa  632  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  42.13 
 
 
728 aa  528  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  42.37 
 
 
733 aa  525  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  44.28 
 
 
687 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  43.84 
 
 
691 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  43.31 
 
 
691 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  43.05 
 
 
691 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  41.92 
 
 
733 aa  510  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  41.37 
 
 
685 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  40.5 
 
 
686 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  40.59 
 
 
685 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  41.23 
 
 
685 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  41.48 
 
 
685 aa  475  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  40.54 
 
 
678 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  39.63 
 
 
689 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  40.32 
 
 
678 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  41.4 
 
 
685 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  40.43 
 
 
686 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  41.5 
 
 
685 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  41.87 
 
 
667 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  41.23 
 
 
685 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  39.92 
 
 
685 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  41.61 
 
 
685 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  40.6 
 
 
662 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  39.07 
 
 
695 aa  445  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  42.16 
 
 
672 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  41.48 
 
 
716 aa  438  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  41.48 
 
 
672 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  39.2 
 
 
630 aa  392  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  37.28 
 
 
651 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  35.73 
 
 
681 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  36.3 
 
 
651 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  37.11 
 
 
638 aa  365  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  38.51 
 
 
619 aa  361  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  37.61 
 
 
697 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  35.84 
 
 
633 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  36.2 
 
 
629 aa  353  8.999999999999999e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  33.46 
 
 
726 aa  349  9e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  35.06 
 
 
639 aa  347  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  35.22 
 
 
632 aa  343  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  35.76 
 
 
634 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  34.56 
 
 
638 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  34.75 
 
 
624 aa  319  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  33.77 
 
 
718 aa  313  7.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  34.47 
 
 
647 aa  310  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  33.97 
 
 
647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  33.38 
 
 
625 aa  293  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  32.24 
 
 
641 aa  292  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  31.94 
 
 
627 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  32.24 
 
 
687 aa  286  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 
658 aa  283  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  32.33 
 
 
663 aa  283  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  32.25 
 
 
689 aa  281  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  30.49 
 
 
593 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  32.65 
 
 
628 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  30.49 
 
 
593 aa  278  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  31.56 
 
 
596 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  30.36 
 
 
593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  32.64 
 
 
628 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  32.74 
 
 
659 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  33.15 
 
 
642 aa  270  8.999999999999999e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  31.41 
 
 
667 aa  269  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 
680 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  32.09 
 
 
640 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  32.2 
 
 
659 aa  267  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  32.56 
 
 
663 aa  267  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  31.22 
 
 
669 aa  263  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  32.3 
 
 
694 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  31.68 
 
 
698 aa  260  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  31.49 
 
 
642 aa  258  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  31.16 
 
 
738 aa  253  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  31.64 
 
 
674 aa  253  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  31 
 
 
744 aa  252  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  32.36 
 
 
690 aa  251  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  31.14 
 
 
674 aa  249  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  31.45 
 
 
695 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  31.52 
 
 
663 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  31.11 
 
 
677 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  30.55 
 
 
696 aa  243  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  31.68 
 
 
693 aa  237  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  30.88 
 
 
708 aa  232  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  31.35 
 
 
699 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  31.22 
 
 
699 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  31.22 
 
 
699 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  30.99 
 
 
704 aa  225  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  30.43 
 
 
684 aa  224  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  29.25 
 
 
702 aa  223  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  29.79 
 
 
821 aa  222  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  28.93 
 
 
694 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  30.5 
 
 
715 aa  218  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  30.06 
 
 
689 aa  216  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  29.79 
 
 
708 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  30.96 
 
 
691 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>