115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1040 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  97.54 
 
 		 691 aa  1387    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  56.42 
 
 		 685 aa  788    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  58.36 
 
 		 689 aa  802    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  52.59 
 
 		 716 aa  679    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  57.86 
 
 		 685 aa  798    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  57.86 
 
 		 685 aa  797    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  59.77 
 
 		 686 aa  823    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  57.58 
 
 		 685 aa  799    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  57.14 
 
 		 686 aa  779    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  57.31 
 
 		 685 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  57.8 
 
 		 685 aa  808    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  58.93 
 
 		 678 aa  822    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  97.54 
 
 		 691 aa  1388    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  57.31 
 
 		 685 aa  795    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  58.39 
 
 		 678 aa  820    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  57.6 
 
 		 685 aa  781    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1420    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  92.04 
 
 		 687 aa  1311    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  57.16 
 
 		 685 aa  793    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  43.84 
 
 		 744 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  44.46 
 
 		 695 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  43.45 
 
 		 667 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  44.08 
 
 		 764 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  46.87 
 
 		 672 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  41.55 
 
 		 716 aa  511  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  43.98 
 
 		 662 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  46.39 
 
 		 672 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  41.67 
 
 		 753 aa  505  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  43.67 
 
 		 741 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  41.22 
 
 		 728 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  43.86 
 
 		 755 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  39.75 
 
 		 733 aa  472  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  41.01 
 
 		 736 aa  475  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  40.08 
 
 		 733 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  41.7 
 
 		 826 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  40.86 
 
 		 651 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  39.02 
 
 		 681 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  36.02 
 
 		 651 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  38.72 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  38.29 
 
 		 638 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  36.1 
 
 		 697 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  39.75 
 
 		 634 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  38.24 
 
 		 638 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  38.43 
 
 		 639 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  38.7 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  37.98 
 
 		 630 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  39.78 
 
 		 619 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  37.26 
 
 		 624 aa  357  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  34.64 
 
 		 726 aa  350  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  36.12 
 
 		 632 aa  345  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  34.32 
 
 		 687 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  33.96 
 
 		 718 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  32.39 
 
 		 658 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  34.78 
 
 		 647 aa  320  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  33.95 
 
 		 627 aa  318  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  33.53 
 
 		 593 aa  318  3e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  32.95 
 
 		 593 aa  312  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  31.83 
 
 		 667 aa  310  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  32.66 
 
 		 593 aa  310  8e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  33.82 
 
 		 647 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  34.61 
 
 		 596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  35.07 
 
 		 625 aa  299  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  33.01 
 
 		 663 aa  299  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  32.85 
 
 		 642 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  33.29 
 
 		 641 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  33.85 
 
 		 689 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  31.88 
 
 		 694 aa  285  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  32.61 
 
 		 628 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  32.61 
 
 		 659 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  32.72 
 
 		 663 aa  283  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  33.71 
 
 		 628 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  32.61 
 
 		 659 aa  283  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  32.97 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  31.43 
 
 		 680 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  32.81 
 
 		 640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  32.2 
 
 		 698 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  32.29 
 
 		 674 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  32.76 
 
 		 674 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  32.32 
 
 		 708 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  32.18 
 
 		 704 aa  262  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  31.75 
 
 		 689 aa  259  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  31.4 
 
 		 691 aa  256  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  32.25 
 
 		 695 aa  253  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  31.84 
 
 		 690 aa  252  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  30.65 
 
 		 684 aa  252  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 		 699 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  31.03 
 
 		 699 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  30.19 
 
 		 738 aa  249  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  30.9 
 
 		 699 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  30.95 
 
 		 744 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  30.34 
 
 		 690 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  31.11 
 
 		 669 aa  243  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  29.8 
 
 		 642 aa  243  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  30.74 
 
 		 696 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  31.79 
 
 		 694 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  31.93 
 
 		 677 aa  237  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  31.02 
 
 		 689 aa  237  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  29.41 
 
 		 708 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  31.6 
 
 		 821 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  31.27 
 
 		 715 aa  226  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>