151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3474 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  60.86 
 
 		 640 aa  767    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  82.35 
 
 		 659 aa  1131    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  54.81 
 
 		 687 aa  691    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  71.78 
 
 		 658 aa  976    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1360    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  82.5 
 
 		 659 aa  1132    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  60.16 
 
 		 628 aa  753    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  67.32 
 
 		 667 aa  924    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  75.15 
 
 		 663 aa  1050    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  51.58 
 
 		 663 aa  649    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  54.99 
 
 		 674 aa  712    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  61.42 
 
 		 628 aa  772    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  47.83 
 
 		 642 aa  575  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  47.85 
 
 		 641 aa  544  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  48.46 
 
 		 647 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  46.83 
 
 		 647 aa  532  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  44.57 
 
 		 689 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  45.52 
 
 		 674 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  43.12 
 
 		 718 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  44.36 
 
 		 695 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  44.92 
 
 		 680 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  45.15 
 
 		 694 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  40.9 
 
 		 704 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  42.68 
 
 		 738 aa  455  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  42.14 
 
 		 698 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  42.11 
 
 		 696 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  43.12 
 
 		 691 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  40.25 
 
 		 708 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  43.47 
 
 		 689 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  42.71 
 
 		 677 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  41.98 
 
 		 684 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  42.13 
 
 		 690 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  43.98 
 
 		 669 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  42.63 
 
 		 690 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  43.83 
 
 		 638 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  41.34 
 
 		 702 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  38.43 
 
 		 642 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  41.71 
 
 		 629 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  43.53 
 
 		 689 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  40.14 
 
 		 699 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  40.14 
 
 		 699 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  40 
 
 		 699 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  42.66 
 
 		 694 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  40.49 
 
 		 624 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  42.18 
 
 		 693 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  40.75 
 
 		 744 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  39.81 
 
 		 639 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  41.19 
 
 		 821 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  40.09 
 
 		 697 aa  412  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  41.42 
 
 		 708 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  39.26 
 
 		 681 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  38.02 
 
 		 638 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  38.76 
 
 		 633 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  41.42 
 
 		 619 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  41.76 
 
 		 634 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  40.83 
 
 		 651 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  43.76 
 
 		 702 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  42.55 
 
 		 630 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  43.63 
 
 		 715 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  39 
 
 		 651 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  38.1 
 
 		 632 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  40.59 
 
 		 672 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  38.9 
 
 		 596 aa  381  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  39.91 
 
 		 695 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  41.41 
 
 		 672 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  39.12 
 
 		 667 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  38.06 
 
 		 625 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  38.81 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  38.14 
 
 		 593 aa  365  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  38.47 
 
 		 593 aa  365  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  34.79 
 
 		 726 aa  361  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  37.74 
 
 		 662 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  36.74 
 
 		 627 aa  353  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  35.52 
 
 		 678 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  35.19 
 
 		 678 aa  333  9e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  35.68 
 
 		 685 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  35.38 
 
 		 685 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  35.05 
 
 		 685 aa  330  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  35.53 
 
 		 685 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  35.68 
 
 		 685 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  35.79 
 
 		 685 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  35.43 
 
 		 686 aa  324  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  35.23 
 
 		 685 aa  323  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  35.94 
 
 		 685 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  34.42 
 
 		 686 aa  320  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  33.66 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  35.48 
 
 		 685 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  33.02 
 
 		 728 aa  316  9e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  36.22 
 
 		 716 aa  309  9e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  34.88 
 
 		 733 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  32.63 
 
 		 764 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  34.29 
 
 		 826 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  33.53 
 
 		 733 aa  290  8e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  32.72 
 
 		 691 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  32.92 
 
 		 736 aa  283  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  32.33 
 
 		 744 aa  283  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  32.82 
 
 		 691 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  32.26 
 
 		 691 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  31.92 
 
 		 687 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  33.38 
 
 		 741 aa  277  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>