160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2410 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  54.97 
 
 
702 aa  703    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  51 
 
 
689 aa  636    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  58.82 
 
 
689 aa  766    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  54.85 
 
 
708 aa  716    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  100 
 
 
715 aa  1450    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  59.21 
 
 
694 aa  759    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  56.22 
 
 
738 aa  736    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  53.44 
 
 
821 aa  688    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  54.24 
 
 
694 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  51.85 
 
 
669 aa  629  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  50.76 
 
 
695 aa  628  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  50.87 
 
 
680 aa  617  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  51.03 
 
 
674 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  50 
 
 
696 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  50.49 
 
 
704 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  50.66 
 
 
677 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  49.16 
 
 
708 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  47.85 
 
 
689 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  47.52 
 
 
698 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  46.72 
 
 
744 aa  569  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  46.63 
 
 
691 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  46.37 
 
 
699 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  50.22 
 
 
693 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  46.37 
 
 
699 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  46.23 
 
 
699 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  46.35 
 
 
690 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  45.17 
 
 
702 aa  545  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  46.84 
 
 
690 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  44.43 
 
 
684 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  43.01 
 
 
647 aa  475  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  43.52 
 
 
647 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  42.6 
 
 
641 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  40.25 
 
 
718 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  42.84 
 
 
658 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  42.42 
 
 
659 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  42.27 
 
 
659 aa  429  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  41.17 
 
 
667 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  43.14 
 
 
663 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  43.78 
 
 
640 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  40.9 
 
 
687 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  43.94 
 
 
628 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  43.02 
 
 
628 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  43.29 
 
 
642 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  41.27 
 
 
663 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  39.37 
 
 
674 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  37.26 
 
 
642 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  40.78 
 
 
663 aa  379  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  39.51 
 
 
681 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  39.48 
 
 
629 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  39.93 
 
 
624 aa  348  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  39.48 
 
 
634 aa  347  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  36.01 
 
 
632 aa  343  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  37.8 
 
 
633 aa  340  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  38.07 
 
 
667 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  39.05 
 
 
630 aa  330  6e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  37.78 
 
 
672 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  36.66 
 
 
638 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  37.9 
 
 
639 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  37.63 
 
 
672 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  37.04 
 
 
638 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  37.2 
 
 
662 aa  319  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 
596 aa  317  6e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  34.6 
 
 
593 aa  317  6e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  36.2 
 
 
593 aa  316  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  35.1 
 
 
697 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  34.6 
 
 
593 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  36.78 
 
 
619 aa  310  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  37.24 
 
 
651 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  34.29 
 
 
726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  36.98 
 
 
651 aa  300  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  34.11 
 
 
627 aa  300  9e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  33.73 
 
 
625 aa  290  7e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  35.57 
 
 
695 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  33.14 
 
 
686 aa  279  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  32.29 
 
 
685 aa  277  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  32.54 
 
 
685 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  32.24 
 
 
685 aa  274  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  33.24 
 
 
716 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  33.43 
 
 
678 aa  272  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  33 
 
 
678 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  31.86 
 
 
685 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  31.62 
 
 
685 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  33.38 
 
 
689 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  31.38 
 
 
685 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  31.24 
 
 
685 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  31.62 
 
 
685 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  32.19 
 
 
685 aa  264  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  32.91 
 
 
686 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  31.6 
 
 
755 aa  261  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  31.07 
 
 
764 aa  259  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  30.51 
 
 
736 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  32.32 
 
 
587 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  31.33 
 
 
733 aa  250  6e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  32.73 
 
 
741 aa  246  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  32.02 
 
 
753 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  30.68 
 
 
733 aa  243  7e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  30.17 
 
 
687 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  30.88 
 
 
744 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  30.23 
 
 
716 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  30.03 
 
 
728 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>