117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1652 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  65.86 
 
 		 764 aa  976    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  65.09 
 
 		 736 aa  935    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  61.72 
 
 		 744 aa  926    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  61.6 
 
 		 753 aa  920    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 741 aa  1504    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  48.92 
 
 		 716 aa  644    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  52.34 
 
 		 755 aa  696    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  53.42 
 
 		 826 aa  631  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  44.25 
 
 		 728 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  43.68 
 
 		 733 aa  534  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  42.52 
 
 		 733 aa  520  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  42.82 
 
 		 685 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  41.51 
 
 		 685 aa  515  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  42.02 
 
 		 685 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  44.14 
 
 		 691 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  42.34 
 
 		 678 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  42.42 
 
 		 685 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  42.29 
 
 		 685 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  43.14 
 
 		 691 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  42.88 
 
 		 691 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  40.72 
 
 		 685 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  42.97 
 
 		 687 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  40.45 
 
 		 685 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  41.53 
 
 		 678 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  40.72 
 
 		 685 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  40.72 
 
 		 685 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  40.72 
 
 		 686 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  40.03 
 
 		 689 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  41.51 
 
 		 686 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  40.66 
 
 		 695 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  39.71 
 
 		 662 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  40.11 
 
 		 667 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  41.26 
 
 		 672 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  39.37 
 
 		 716 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  41.28 
 
 		 672 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  39.16 
 
 		 681 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  37.13 
 
 		 651 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  38.63 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  35.8 
 
 		 726 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  36.93 
 
 		 651 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  38.12 
 
 		 630 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  37.18 
 
 		 697 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  38.19 
 
 		 619 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  36.38 
 
 		 639 aa  364  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  37.45 
 
 		 638 aa  359  8e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  35.98 
 
 		 632 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  35.5 
 
 		 638 aa  350  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  37.11 
 
 		 634 aa  348  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  35.31 
 
 		 633 aa  343  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  35.05 
 
 		 624 aa  330  7e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  33.42 
 
 		 718 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  34.79 
 
 		 593 aa  324  4e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  34.66 
 
 		 593 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  34.52 
 
 		 593 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  34.16 
 
 		 647 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  33.2 
 
 		 647 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  33.99 
 
 		 689 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  33.29 
 
 		 687 aa  300  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  31.91 
 
 		 627 aa  298  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  32.66 
 
 		 658 aa  298  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  32.33 
 
 		 641 aa  293  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  33.69 
 
 		 680 aa  293  9e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  31.97 
 
 		 628 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  34.04 
 
 		 695 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  32.05 
 
 		 628 aa  291  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 694 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  34.24 
 
 		 738 aa  289  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  32.56 
 
 		 640 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  31.36 
 
 		 667 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  33.51 
 
 		 663 aa  284  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  32.8 
 
 		 625 aa  282  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  33.29 
 
 		 642 aa  277  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  32.58 
 
 		 659 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  32.85 
 
 		 659 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  32.71 
 
 		 663 aa  275  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  32.29 
 
 		 596 aa  273  9e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  33.53 
 
 		 669 aa  272  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  32.45 
 
 		 698 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  31.68 
 
 		 674 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  34.61 
 
 		 690 aa  270  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  31.32 
 
 		 744 aa  264  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  31.74 
 
 		 663 aa  265  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  30.72 
 
 		 642 aa  262  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  32.27 
 
 		 677 aa  259  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  32.26 
 
 		 674 aa  258  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  32.89 
 
 		 684 aa  256  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  31.9 
 
 		 694 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  30.8 
 
 		 708 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  31.55 
 
 		 704 aa  252  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  30.96 
 
 		 696 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  32.41 
 
 		 691 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  32.56 
 
 		 689 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  31.67 
 
 		 699 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  31.67 
 
 		 699 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  31.67 
 
 		 699 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  31.77 
 
 		 702 aa  237  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  32.74 
 
 		 715 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  31.16 
 
 		 690 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  30.52 
 
 		 821 aa  232  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  30.78 
 
 		 708 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>