65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3949 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  771    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  88.51 
 
 
383 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  68.31 
 
 
386 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  70.47 
 
 
386 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  67.96 
 
 
389 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  66.84 
 
 
383 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  63.57 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  62.95 
 
 
386 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  63.38 
 
 
377 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  49.26 
 
 
328 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  44.65 
 
 
369 aa  281  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  33 
 
 
444 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  33.18 
 
 
443 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  33.33 
 
 
440 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  31.37 
 
 
471 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  29.79 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  31.47 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  30.24 
 
 
458 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  28.32 
 
 
504 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  29.65 
 
 
445 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  32.95 
 
 
499 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  27.59 
 
 
461 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  30.94 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  29.34 
 
 
494 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  29.48 
 
 
455 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  29.48 
 
 
587 aa  103  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  27.41 
 
 
630 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  28.62 
 
 
560 aa  86.3  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  33.08 
 
 
631 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  24.74 
 
 
624 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  25.45 
 
 
612 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  28.57 
 
 
607 aa  54.3  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  33.33 
 
 
587 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 
633 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  27.27 
 
 
663 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  23.33 
 
 
442 aa  49.7  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  27.03 
 
 
674 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  28.91 
 
 
638 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  26.32 
 
 
634 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  28.91 
 
 
639 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  27.15 
 
 
624 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  30.71 
 
 
628 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  23.4 
 
 
593 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  28.68 
 
 
663 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  23.4 
 
 
593 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  26.79 
 
 
625 aa  46.2  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.4 
 
 
593 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 
627 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  26.79 
 
 
681 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  25.42 
 
 
629 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  28.33 
 
 
583 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  29.92 
 
 
628 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  38.18 
 
 
630 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  28.68 
 
 
632 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  21.96 
 
 
651 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  27.92 
 
 
693 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  28.76 
 
 
739 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  26.92 
 
 
689 aa  44.3  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  31.5 
 
 
640 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  28.35 
 
 
663 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  48.89 
 
 
718 aa  43.1  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  27.33 
 
 
638 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  27.45 
 
 
619 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  25 
 
 
630 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>