113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00705 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  919    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  65.56 
 
 		 461 aa  618  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  57.17 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  44.78 
 
 		 471 aa  363  3e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  45.35 
 
 		 444 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  45.31 
 
 		 440 aa  342  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  44.08 
 
 		 422 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  43.6 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 484 aa  249  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  36.36 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  38 
 
 		 499 aa  243  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  35.92 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  35.1 
 
 		 494 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  35.34 
 
 		 504 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  27.57 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  26.76 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  28.43 
 
 		 386 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  25.89 
 
 		 383 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  30.74 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  28.47 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  29.7 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  31.15 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  26.32 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  26.7 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  23.46 
 
 		 587 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  22.86 
 
 		 593 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  22.68 
 
 		 593 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  22.86 
 
 		 593 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  24.18 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  25.84 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  31.71 
 
 		 624 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  25.48 
 
 		 739 aa  70.1  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  27.3 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  20.9 
 
 		 639 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  29.27 
 
 		 612 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  24.87 
 
 		 624 aa  65.1  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  27.1 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  22.3 
 
 		 633 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  23.92 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  23.69 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  23.02 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  21.28 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  25.74 
 
 		 697 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  23.61 
 
 		 632 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  34.78 
 
 		 786 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  21.42 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  28.25 
 
 		 626 aa  56.6  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  23.18 
 
 		 628 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  23.93 
 
 		 619 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  28.75 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  23.47 
 
 		 638 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  23.08 
 
 		 628 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  22.75 
 
 		 663 aa  54.3  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  23.24 
 
 		 627 aa  53.5  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  23.72 
 
 		 625 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  22.07 
 
 		 640 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  22.89 
 
 		 642 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  26.84 
 
 		 685 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  26.2 
 
 		 685 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2679  protein of unknown function DUF839  29.82 
 
 		 493 aa  50.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  23.8 
 
 		 698 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  25.88 
 
 		 685 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  25.56 
 
 		 685 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  25.56 
 
 		 685 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  31.94 
 
 		 642 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  22.67 
 
 		 662 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  28.57 
 
 		 696 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  25.88 
 
 		 685 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  24.62 
 
 		 686 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  21.81 
 
 		 753 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01880  hypothetical protein  65.62 
 
 		 59 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0620903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  29.33 
 
 		 693 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  24.87 
 
 		 667 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3179  protein of unknown function DUF839  26.5 
 
 		 818 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  21.11 
 
 		 695 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  30 
 
 		 821 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  24.37 
 
 		 686 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  31.78 
 
 		 663 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  30.2 
 
 		 718 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  29.03 
 
 		 704 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  26.92 
 
 		 755 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  30.53 
 
 		 651 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  29.55 
 
 		 715 aa  47  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  28.42 
 
 		 685 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  29.46 
 
 		 659 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  28.67 
 
 		 699 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  28.67 
 
 		 699 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  31.01 
 
 		 659 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  28.67 
 
 		 699 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  33.83 
 
 		 702 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  24.4 
 
 		 583 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  24.92 
 
 		 685 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  28.48 
 
 		 607 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  21.57 
 
 		 687 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  29.85 
 
 		 689 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  22.19 
 
 		 689 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  28.72 
 
 		 689 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  27.81 
 
 		 651 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  24.9 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  22.88 
 
 		 630 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>