14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01880 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01880  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  124  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0620903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  64.91 
 
 
494 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  56 
 
 
458 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  50.98 
 
 
444 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  61.76 
 
 
440 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  65.62 
 
 
442 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  50 
 
 
422 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  50 
 
 
435 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
484 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  48.65 
 
 
461 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
504 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  40.32 
 
 
499 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  44.19 
 
 
443 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  48.65 
 
 
471 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>